張居正早就知道這些士紳們的套路，士紳們最擅長的就是利用士林清議給官員、朝廷施加壓力，好達到自己的目的。
士紳們通過什么操縱士子們，就是書院。你當士紳們是做什么慈善啊，他們捐資助學，興辦書院都是有他們不可告人的目的的。當然，其中也不乏王守仁、湛若水、耿定向等人，他們創辦書院的目的相對比較單純，就是為了傳播自己的學術思想。
但是士紳們的目的就不是那么單純了，他們捐資助學，都是有目的的。第一就是通過捐資助學，資助一些有天賦的寒門子弟讀書科舉，可以提前與這些未來的官員們綁定，士紳們資助這些寒門子弟，就是施恩于他們，等到日后他們高中進士，步入官場，就已經與士紳們深度綁定了。
從人情上說，士紳們是這些寒門子弟的恩人，從這些寒門子弟來說，盡管他們高中進士，步入官場，但是官場勢力盤根錯節，豈是他們這些新科進士能夠擺得平的，而這個時候這些士紳們就會再次對他們施以援手，士紳們在官場擁有龐大的關系，可以為這些新科進士們在官場上提供助力。
更有甚者，通過婚姻的方式與這些寒門子弟深度綁定，將他們納入自己的家族中來，而受了士紳們這么多恩惠，他們也要對士紳們加以回報，在朝堂上為他們搖旗吶喊，為士紳們張目。
張居正很清楚這里面的關節，所以在張居正看來，這種書院就是禍亂的根源。
張居正在給朱載坖的奏疏中認為，本朝一天下尤以學校為先務，慎選舉以崇教職，嚴條約以厲生徒。朝廷興辦了大量的學校，從社學一直到國子監，就是為了培養人才。
洪武元年，剛剛在應天府即位的太祖皇帝就頒布上諭：改天下山長為訓導，田皆令入官，規定由官府辦學。洪武朝新建書院有24所，永樂朝新建書院有11所，宣德朝新建書院有3所，全國總共也就三十多所新建的書院，官學大盛，私學自然不振。
而從正統以來，法紀松弛，官學逐漸衰落，日削月駿，寢以傾圮，庭宇荒蕪三十余年，不堪其敝陋，其中對于官靴沖擊最大的就是捐納制度，自從大明建立以來就有的監生制度，經過長期的發展，已經變成了一些官員買官、賣官，非法謀取私利的手段，嚴重阻礙了朝廷選拔人才和科舉制度的順利進行。
也使得官學根本不能為朝廷選拔人才。所以最開始是由朝廷對社學加以擴建興辦書院，但是這個口子一開，就給了士紳們機會，士紳借此機會大量的興辦書院，無論是數量還是學生人數都遠遠超過了官辦的書院，所以張居正建議嚴厲整頓書院，將所有書院納入官辦，不允許私人辦學。
對于私人書院，張居正認為應當嚴厲打擊，凡是不奉明旨私自創建，令有司改毀，同時制定約束士子的規章，張居正在奏疏中稱：毋及朝廷利害、邊報差除，毋及官長賢否、政事得失，毋及各人家門私事與眾人所作過失及詞訟請托等事。
這樣的話，讓學校回歸教書育人的本職，可以遠離政治紛爭，還書院一片凈土。
張居正的奏疏到了朱載坖的案頭之后，朱載坖是大為贊賞，認為張居正的奏疏極為合適，當即召集內閣和吏部尚書楊博、禮部尚書高儀，要求盡快將張居正的奏疏變成朝廷的法條實施。
對于張居正的奏疏，高拱等人是極為支持的，他們和張居正一樣反感這些生員士子議論國事，甚至用所謂的士林清議干擾朝廷行政，但是徐階和李春芳則是態度曖昧。
徐階和李春芳很清楚，張居正對所謂的心學不感冒，甚至對于心學中的何心隱之輩極為鄙視，他們擔心一旦朝廷將所有書院收歸官辦，會以朝廷的力量支持理學，打擊心學，所以態度有些曖昧。
朱載坖當然知道徐階和李春芳在猶豫什么，他對兩位閣臣說道：“即便是官辦書院，也可以講學，但只不議論朝政，煽惑人心即可。”
此事有高拱、張居正和楊博的全力贊同，朱載坖也要力推此事，再加上朱載坖已經答應在官辦書院中也可以傳播心學，徐階和李春芳也就答應下來，朱載坖隨即下令禮部制定相關法令，而指令督師南京的張居正在將浙直等處的書院收歸官辦，從速辦理。
張居正一直不見這些士子們，在無錫的嚴紹庭也就將華府圍起來，和無錫縣的士子們對峙，但是雙方的矛盾是在不斷地積累當中的。
終于，隆慶元年十二月二十一日，大寒，從京師來的急遞送來了朱載坖的上諭，要求張居正將浙直等處書院收歸官辦，由學政加以管理，同時不準生員議論國事，這下無論是在督師行轅外想找張居正要個說法的士子們還是他們背后的士紳們都暴怒了。
沒想到張居正和他們玩陰的，明里拖延時間，背地里卻通過密疏向朱載坖請旨，給了東南士紳們后心一刀，將書院收歸官辦，嚴禁士子議論國事，這兩條就是為東南的士紳們和士子們量身打造，就是為了收拾他們，張居正現在上諭在手，才不怕有人敢鬧事呢。
隨即張居正下令督師標營參將吳惟忠率兵進城，與南京守備恭順侯吳繼爵一道維持秩序，嚴防士子們作亂。吳繼爵立刻指揮南京京營的官軍加強文廟、督師行轅、孝陵的防護，孝陵衛也枕戈待旦，嚴防滋擾。
這些士子們一見張居正居然算到他們前面去了，將他們原本打算去的地方都提前派兵把守，不由得更加憤怒，大批士子們集中起來，準備沖擊督師行轅，讓張居正滾出東南。
張居正這個時候也不裝了，既然你們要找死，也怪不得張某人心狠手辣了，張居正請出天子劍，令督師標營參將吳惟忠率兵將鬧事的士子全部抓捕，送南京錦衣衛嚴審。最近轉碼嚴重，讓我們更有動力，更新更快，麻煩你動動小手退出閱讀模式。謝謝</p>