而對于朱載坖和內閣輔臣們來說，比較頭疼的是這些藩屬國的班次問題，大明已經很久沒有藩屬參加正旦日大朝會了，即便是有，之前也就是只是朝鮮、琉球這些對大明仍舊比較親近的藩屬，但是這次不一樣，按照禮部和理藩院的上奏，這次來參加正旦日大朝會的藩屬可是不少。
除了老面孔朝鮮、琉球之外，還有順義王不他失禮和忠順夫人三娘子、黃臺吉、把漢那吉的使節，西域諸國的使臣、活佛索南加措的使臣，還有倭國暹羅、占城、安南都統司、女真人的使臣，以及尼德蘭、佛郎機等國的使臣。
其實最好處理的反而是西夷，他們反正又不是大明的藩屬，不懂這個班次的意義，也好糊弄，難得就是這些大明的藩屬，他們多多少少是了解一點朝會的情況，像朝鮮還是漢化很深的國家，對于大明的典章制度是十分的熟悉，對于這些事情也很清楚，朝班對于他們來說還是非常敏感的一件事情。
這點令朱載坖還是有些擔憂的，畢竟這些人都是大明的藩屬，大明必須要確定一個完備的藩屬朝班，以保證這些藩屬不搞事情出來，經過朱載坖和內閣、禮部、理藩院等衙門的商量，決定將這些藩屬分為兩班，藩國和屬夷，藩國由朝鮮領班，包括朝鮮、倭國、琉球、暹羅、占城等藩國。
屬夷由順義王領班，包括西北番部、女真人、索南加措、安南都統司等屬夷，這樣的話算是比較好的解決了這個問題。
除此之外，為了保證大朝會之前京師的風貌，朱載坖還命令五城兵馬司和錦衣親軍嚴厲整頓京師市容，同時將之前由錦衣親軍所負責的京師溝渠的街道房轉交由五城兵馬司負責，凡京城內外修理街道、疏通溝渠，本衛指揮一員，奉旨專管，領屬官三員、旗校五十名。
朱載坖嚴令嚴紹庭和陸繹，要整頓京師和北直隸附近的治安，保障使節不受騷擾，還有京師的市容務必要整潔，以展現大明強大的國力，這些主要都是給這些藩屬和西洋使節看的。
還是一個問題是大明現在有一幫傳教士在文思院、國子監、測繪學堂等衙門里面任職，為了顯示朝廷對于他們的重視，朝廷都給他們授予翰林待詔等官職，這些人要不要參加正旦日大朝會，他們參加朝會，班次怎么確定？這確實是個問題。
朱載坖在和禮部商量了之后認為他們現在既然已經是大明的官吏了，就應該參加大明的正旦日大朝會，但是由于他們身份的特殊性，全部到文思院衙門站班，作為近侍衙門參加大朝會，班次在六科之后。
同時宗人府也上疏，按照洪武舊例的話，正旦日大朝會，各地的藩王也需要派人參加，并且向朝廷朝賀，這次朝廷召開正旦日大朝會，是否需要召藩王進京。
朱載坖認為，召藩王進京大可不必了，這些藩王們到京師來，興師動眾的，到時候徒耗錢糧，根本沒有必要，只是令他們派遣人進貢方物就行了，藩王們由現在在京師的鄭王朱厚烷和端王朱翊鈞代表就行了。
經過好一番折騰，朱載坖和內閣、禮部等衙門才將正旦日大朝會的相關儀注全部制定好了，由于隆慶十五年是大計之年，按照朝廷規定，地方布按衙門、督撫大員都要分批到京師接受審計和考核，所以正旦日大朝會的事情，北方各省的地方官也要到場。
而朱載坖也命令總督薊遼兵部尚書譚綸和提督薊遼軍務曹國公李庭竹要派遣官軍，剿滅地方的土匪等，防止他們作亂，地方的州縣也要嚴加緝捕，防止這些人作亂。
而接近歲尾年終，朱載坖和內閣商量隆慶十五年的一些事情，主要就是地方財政的編制，按照內閣之前給各督撫、布按等司下達命令，今年是要編制相關的預算，重新確定留存和起運的數字，對于朱載坖來說，這是大明從靜態財政向動態財政過渡的一個重要的環節，所以朱載坖對此是極為重視的。
對于各省上報的預算，朱載坖命令戶部和工部要嚴厲審核，對于這些省份上報的留存錢糧的使用也予以核查，不必要的項目一律要予以取消，保證朝廷的中樞的財政收入。
同時要均衡南北，對于北方的一些基礎設施，如農田水利、道路等，朝廷要多加支持，對于南方的防洪建設也要重視，朱載坖的原則也很簡單，就是移南就北，加大朝廷對于北方各省的支持力度，尤其是北直隸、遼東、河南、寧夏等地，朝廷要加強扶持的力度，對于黃河的堤防也要予以重視。
同時朱載坖在和工部、總督河道潘季馴商量之后，決定調整對于運河和黃河的治水方略，之前由于朝廷要保障漕運，所以之前治河的方略就是保障運河，所以犧牲河南、淮河流域的農業，以保障朝廷的漕運，現在海運已經承擔了絕大多數漕糧運輸，對于朝廷來說，運河的重要性已經大幅度下降了，朝廷對于治河的方略的也要調整。
朱載坖認為，應該在保障運河和維護沿岸農業生產之間取得平衡，不僅僅要以維護運河通暢作為朝廷治水的目的，也要保證沿岸地方的利益，所以朝廷下一步的治水方略就是維護地方的利益為主，要保護河南、南直隸鳳陽等府縣的地方利益，在此地興修各種水利工程，平衡地方和運河的利益，在盡可能保護運河通暢的情況下，保障地方州縣的利益。
經過工部和戶部的核算之后，最終向朱載坖呈遞了各省的預算草案，根據戶部的統計，按照這份草案的話，朝廷和地方的賦稅分成大概在六四開，雖然朝廷比之前減少了起運錢糧，但是地方官府要做的事情也更多了，地方官府要負責本轄區的各種工程的興修，倉儲的完善，使得朝廷對于地方控制加強。</p>