對于張居正的看法，朱載坖也是同意的，大明這次是要大張旗鼓的征討倭國，所以名正言順是非常重要的事情，對于大明來說，對于一個屬國大規模用兵，在理由上必須是說的過去的，還有就是倭國遠在萬里之遙，后勤糧秣的補給肯定是非常重要的，兵馬未動糧草先行，戶部和相關衙門肯定是要立即制定相應的計劃，準備向安東都護府轉運各種糧秣。
廷議的絕大部分臣子都贊同徐渭的主張，對豐臣秀吉大舉用兵，朱載坖隨即決定對倭國用兵，同時根據張居正的請求，還是要讓倭國國王向大明上表請求天兵才行，畢竟該走的程序還是要走，名不正則言不順嘛。
而朱載坖也將嚴世蕃、王直等召回京師，嚴世蕃仍舊負責軍器監、造船和文思院事務，王直升少府卿負責在倭國偽官軍籌措糧餉，同時以對佛郎機的和議成功為由，嚴世蕃加太子太保、參贊軍務大臣，王直加太子少保。
在廷議之后，朱載坖和閣部，以及參贊軍務大臣們一道商量對倭國用兵的事情，對于倭國用兵，朱載坖并不擔心官軍的戰斗力，現在安東都護已經和倭國軍隊多次交手了，倭國軍隊是什么水平大致也有些了解了，吳惟忠、李如松都是當世名將，收拾這幫倭人并不是什么難事。
關鍵的問題是如何保障后勤和朝廷要達到什么樣的目的，畢竟安東都護府和大明的聯系都是通過海運，現在朝廷雖然在佐渡島上屯墾并且開發佐渡島上的金銀礦，但是要大規模用兵倭國，肯定是要增兵增餉的，徐渭要求朝廷再增兵三萬，使得安東都護府的兵力達到八萬之眾，然后加上一些倭國仆從軍，總兵力可以達到十五萬，絕對足夠鎮壓倭國的大名了。
朱載坖當然是同意了徐渭的要求，調神機營和五軍營一部加上金吾前衛、騰驤右衛共計三萬，馳援安東都護府，同時調撥相應的糧秣，為了征討倭國，朝廷在朝鮮的釜山設立了龐大的后勤倉庫，用以轉運物資，現在為了向安東都護府轉運糧秣，不僅大明要雇傭百姓，也要動員朝鮮的百姓，幫助大明轉運糧秣，朱載坖命令駐朝大臣曉諭朝鮮國王，要求朝鮮官府配合大明東征。
而在倭國，大明和豐臣秀吉的關系也基本上算是徹底破裂了，原本足利義昭和織田信長是尖銳對立的，但是現在在毛利輝元的調停下了，足利義昭緩和了和豐臣秀吉的關系，豐臣秀吉的想法是足利義昭繼續擔任有名無實的所謂將軍，而豐臣秀吉自己則擔任關白兼太政大臣，也就是倭國的宰相。
但是在倭國，要想位極人臣，還是要當將軍的，但是要當將軍，必須是武家出身才行，所謂武家，就是指武士系統的家族、人物，與“公家”相對。其核心是平氏和源氏。武家是從在古代公家的領地、莊園中負責武備警衛的家族發展而來，原是為公家所統治的階層，后逐漸壯大，實質性地把持了倭國政權，繼而建立了鐮倉幕府，公家則被傀儡化。隨著武家完全掌握了權力的中心，征夷大將軍成為倭國的實權人物，而要想擔任將軍，就必須得是武家出身。
而豐臣秀吉是什么出身？沒有出身，他父親木下彌右衛門是織田信秀的親兵，自己連個姓都沒有，想要當將軍，在倭國基本是不可能的，所以說豐臣秀吉就像人足利義昭為義父，混上足利家的姓，好當將軍，要是在大明，改姓那是奇恥大辱，一般人都不能接受的，呂布都沒改姓董啊，但是在倭國這種人均道德水平負數的國家，改個把姓根本不是問題，豐臣秀吉更是改姓跟吃飯喝水一樣。
所以豐臣秀吉是沒有任何負擔的，甚至為此已經派人和足利義昭接觸了，但是被人偷偷的給泄露風聲給徐渭了，是誰泄露的風聲呢？丹羽長秀，作為織田信長最信任的家臣，在織田家的重臣中，柴田勝家和丹羽長秀是織田家的譜代重臣，池田恒興是信長奶媽之子與信長如同兄弟，豐臣秀吉和瀧川一益只算是后輩，織田信長死后，丹羽長秀就看出來豐臣秀吉不是個東西，為了保全織田家的血脈。
在本能寺之變后，丹羽長秀將織田信長的嫡孫織田秀信送往大明安東都護府，至少可以保全性命，而事情的發展也果然不出丹羽長秀的預料，在坐穩了位置之后，豐臣秀吉就家那個屠刀揮向舊主織田信長的血脈，織田信長的兩個兒子織田信孝和織田信雄先后被殺，而現在豐臣秀吉更是想當將軍，這是丹羽長秀所不能容忍的。
為了破壞豐臣秀吉的計劃，丹羽長秀向徐渭密報了此事，而徐渭的反應也是非常之快的，在收到了朱載坖的旨意之后，當即命令李如松率領精騎，同時以倭國國王的名義迎接足利義昭到倭國京都去，之前在和織田信長的斗爭中失敗，所以足利義昭被逐出京都，寄居于毛利輝元的地盤。
足利義昭移駕到毛利輝元轄下備后國的鞆。鞆是當年足利尊氏接受光嚴上皇追討新田義貞院宣的地方，對于足利將軍家可謂是有淵源的地方。此后足利義昭在此地開設流亡幕府，史稱“鞆幕府”。足利義昭在鞆以備中國的御料所所進獻的年貢，以及足利將軍家任命京都五山住持所獲得的禮錢維持生活，同時收到宗氏、島津氏通過明倭貿易獲得的財政收入，近畿、東海以外支持足利將軍家的武家很多。
而大明官軍又攜帶倭國國王的命令，重新請足利義昭回到京都，對于足利義昭來說自然是求之不得的好事，因為室町幕府和大明的關系是相對不錯的，所以足利義昭高高興興的回到京都繼續當將軍了，得知此事的豐臣秀吉自然是暴怒了。</p>