孫傳庭得知消息后，立刻進宮向朱由檢稟報：“陛下，機會來了！‘光明使者’三日后將現身城西廢棄廟宇，正是我們將其一網打盡的好時機。”
朱由檢果斷下令：“孫愛卿，你親自率領五百精兵，埋伏在廟宇周圍。待邪教頭目全部到齊后，聽朕命令，發動突襲。洪愛卿、楊愛卿，你們安排人手封鎖周邊道路，防止邪教徒逃竄，同時準備好對受蠱惑百姓的解救和安撫工作。”
三人齊聲領命：“陛下放心，臣等定當全力以赴！”
三日后，夜幕降臨，城西廢棄廟宇周圍一片寂靜。孫傳庭帶領著精兵，悄無聲息地埋伏在四周，等待著行動的信號。
不一會兒，只見一群黑影朝著廟宇聚集。等邪教頭目們全部進入廟宇后，朱由檢一聲令下：“行動！”
孫傳庭手持長劍，率先沖入廟宇，大喊道：“邪教徒，你們的末日到了！”精兵們如猛虎下山般，迅速將廟宇包圍，與邪教徒展開激烈搏斗。
邪教徒們雖負隅頑抗，但怎敵孫傳庭率領的精銳之師。很快，邪教徒便紛紛倒地，束手就擒。
“光明使者”見勢不妙，企圖逃跑。孫傳庭眼疾手快，一個箭步沖上前去，攔住他的去路：“你這惡賊，往哪里跑！”
“光明使者”面露猙獰，抽出匕首，朝著孫傳庭撲來。孫傳庭側身一閃，輕松避開，反手一劍，刺中了“光明使者”的手臂。“光明使者”慘叫一聲，匕首落地，被孫傳庭當場擒獲。
與此同時，洪承疇和楊嗣昌帶領的人手也順利封鎖了周邊道路，防止了邪教徒的逃竄。解救出的百姓們一臉茫然，對發生的事情還未反應過來。
洪承疇走上前，對百姓們說道：“鄉親們，你們受邪教蠱惑，險些釀成大禍。如今邪教已被鏟除，大家莫要害怕。朝廷會安排人幫你們恢復正常生活。”
楊嗣昌也說道：“是啊，鄉親們，那‘光明圣教’皆是騙人的把戲，所謂的世界末日、光明神都是無稽之談。大家以后切不可再輕信這些歪理邪說。”
百姓們這才如夢初醒，紛紛懊悔不已，對朝廷的解救感激涕零。
將邪教首要分子押解回宮后，朱由檢親自審問“光明使者”：“你這惡徒，為何要在京城蠱惑百姓，擾亂治安？”
“光明使者”卻仍嘴硬，叫嚷道：“我是奉光明神之命，拯救世人。你們這些凡人，怎會懂！”
朱由檢怒喝道：“一派胡言！你分明是利用百姓的無知和恐懼，騙取錢財，擾亂社會。來人，將他打入大牢，擇日問斬！其余邪教頭目，一并嚴懲！”
處理完邪教首要分子后，朱由檢對洪承疇、楊嗣昌和孫傳庭說道：“此次雖成功鏟除了京城內的邪教組織，但不可掉以輕心。洪愛卿，你安排人手繼續在京城及各地排查，防止還有漏網之魚。楊愛卿，加大對百姓的教化力度，通過張貼告示、開設宣講堂等方式，讓百姓認清邪教的危害，提高防范意識。孫愛卿，加強京城的治安巡邏，確保類似事件不再發生。”