高拱接著說：“沒錯，陛下。而且在打擊走私的同時，要注意平衡好對沿海經濟的影響，不能因為整治而阻礙了正常的發展。”
……
在成功肅清東南沿海的走私之風后，朱由檢還未來得及稍作喘息，西南地區便傳來了令人憂心的消息。西南多地突發匪患，且土司余孽復蘇，趁亂作惡，燒殺搶掠，百姓苦不堪言。匪患與土司余孽相互勾結，使得局勢愈發復雜嚴峻。
這日，朱由檢在乾清宮緊急召見洪承疇、楊嗣昌和孫傳庭。他神色凝重，語氣沉重地說道：“諸位愛卿，西南地區匪患猖獗，土司余孽也死灰復燃，攪得當地民不聊生。朕決意盡快平定匪患，鏟除土司余孽，恢復西南太平，不知諸位有何良策？”
洪承疇微微皺眉，沉思片刻后說道：“陛下，西南地勢復雜，山林茂密，匪患與土司余孽盤踞其中，易守難攻。臣以為，當務之急是要派遣熟悉西南地理與風土人情的將領，率領精銳之師，深入匪巢。同時，需精準掌握匪患與土司余孽的兵力部署、行動規律，制定詳細作戰計劃，做到知己知彼，百戰不殆。”
楊嗣昌緊接著說道：“陛下，洪大人所言極是。除此之外，糧草軍需的供應至關重要。西南路途遙遠，運輸不便，需提前規劃好運輸路線，確保前線物資充足。另外，要安撫好當地百姓，匪患當前，百姓人心惶惶，若能得到百姓支持，可為平亂提供諸多便利，比如提供情報、協助運輸等。”
孫傳庭表情嚴肅，補充道：“陛下，平定匪患，軍事行動固然重要，但也要注重后續治理。土司制度在西南實行已久，雖經改革，但余孽尚存。待匪患平定后，需重新規劃西南地區的治理方式，加強朝廷管控，防止類似情況再次發生。”
朱由檢目光堅定地看著三位大臣，說道：“諸位愛卿所慮周全，此乃朕之幸，大明之幸。洪愛卿，你負責挑選將領，籌備軍事行動，制定詳細作戰計劃；楊愛卿，統籌糧草軍需供應，安撫百姓，穩定民心；孫愛卿，提前謀劃西南地區后續治理之策。朕授予你們全權，務必早日平定匪患，還西南百姓安寧。”
洪承疇、楊嗣昌、孫傳庭三人齊聲應道：“臣等領命，不負陛下重托！”
會后，洪承疇立刻著手挑選將領。他翻閱眾多將領的履歷，與熟悉西南情況的官員交流，最終選定了一位名叫陳奇的將領。陳奇曾在西南地區任職多年，對當地地理和匪患情況較為了解，且作戰勇猛，足智多謀。
洪承疇將陳奇召至府中，嚴肅地說道：“陳將軍，陛下命你率精銳之師平定西南匪患，此乃重任在肩。你需盡快了解匪患與土司余孽的詳細情況，制定作戰計劃，務必一舉成功。”
陳奇抱拳，堅定地說道：“大人放心，末將定不辱使命。只是西南地勢復雜，匪患狡猾，還望大人能多提供些情報支持。”
洪承疇點頭道：“這是自然。我會安排斥候深入西南，為你打探情報。你回去后，即刻整頓兵馬，隨時準備出發。”
與此同時，楊嗣昌也開始忙碌起來。他與戶部官員商議，調撥大量糧草。“西南匪患平亂，糧草供應是關鍵，務必保證足額按時送達。”隨后，他又安排人員采購各類軍需物資，如兵器、盔甲等。“兵器要鋒利，盔甲要堅固，方能讓將士們在戰場上無后顧之憂。”
楊嗣昌深知安撫百姓的重要性，他親自起草安民告示，派遣官員到西南各地張貼。告示中承諾朝廷定會平定匪患，保障百姓安全，并鼓勵百姓協助官軍。
孫傳庭則召集幕僚，日夜商討西南地區后續治理之策。“土司余孽復蘇，說明我們對西南的治理還存在漏洞。此次平亂后，必須加強朝廷對地方的控制，改革治理制度。”
數日后，洪承疇進宮向朱由檢奏報：“陛下，陳奇將軍已挑選完畢，正整頓兵馬。斥候傳來消息，匪患與土司余孽盤踞在西南山區的幾個據點，相互呼應。陳將軍計劃先切斷他們之間的聯系，然后逐個擊破。”
朱由檢點頭道：“此計甚好。告訴陳將軍，讓他務必小心行事，不可輕敵。有任何情況，及時奏報。”
楊嗣昌也進宮奏報：“陛下，糧草軍需已籌備完畢，運輸路線也已規劃好，隨時可以起運。安民告示已張貼出去，目前西南百姓情緒稍有穩定，不少百姓表示愿意協助官軍。”