但是，好景不長。在一次對晶體能量傳導機制的關鍵研究中，雙方出現了嚴重的分歧。神秘勢力的科研人員提出了一種冒險的研究方案，他們認為這樣可以更快地解開晶體的能量奧秘，但聯盟的科研人員認為這個方案風險過高，一旦失敗可能會導致晶體能量失控，對周圍的一切造成毀滅性的打擊。
雙方各執一詞，互不相讓，合作的氣氛再次變得緊張起來。而在合作基地之外，雙方的普通成員也開始對合作產生了懷疑。聯盟中的一些人擔心神秘勢力會在關鍵時刻突然變卦，利用晶體的力量來對付聯盟；神秘勢力那邊也有部分人認為聯盟在研究過程中有所保留，并沒有真正把共享研究成果放在心上。
這種緊張局勢不斷升級，聯盟和神秘勢力的高層都意識到，如果不能妥善解決這個問題，剛剛建立起來的脆弱合作關系將徹底破裂，雙方很可能再次陷入殘酷的戰爭。
林軒決定親自前往合作研究基地，與神秘勢力的領袖進行面對面的溝通。在會面中，林軒強調了雙方合作的初衷是為了共同探索晶體的秘密，而不是為了爭奪控制權或者互相算計。他表示，雖然雙方存在分歧，但應該通過理性的討論和科學的論證來解決，而不是意氣用事。
神秘勢力的領袖也表達了類似的觀點，他們都明白，晶體的力量太過強大，如果不能合作研究，任何一方單獨掌握都可能帶來無法預估的災難。經過艱難的談判，雙方最終達成了一個新的共識：重新組建一個由雙方代表組成的評估小組，對有爭議的研究方案進行全面、科學的評估，根據評估結果來決定是否采用。
這個決定暫時緩解了合作中的緊張局勢。評估小組迅速開展工作，他們對神秘勢力提出的方案進行了詳細的分析、模擬和試驗。在這個過程中，雙方科研人員再次放下成見，積極參與到評估工作中。
最終，評估小組得出結論：神秘勢力的方案雖然具有一定的創新性，但風險確實過高，需要進行大幅度的修改才能確保安全。神秘勢力接受了這個結論，并與聯盟的科研人員一起對方案進行了改進。
經過這次風波，聯盟和神秘勢力的合作關系變得更加穩固。雙方科研人員在之后的研究中更加緊密地合作，不斷取得新的研究成果。然而，他們也清楚，隨著對晶體研究的深入，未來可能還會遇到更多的挑戰和分歧，但只要雙方保持溝通與合作，就有希望共同解開晶體的所有秘密，走向一個全新的未來。
隨著研究的持續推進，晶體的秘密一點點被揭開。科研人員發現，晶體的能量不僅可以用于軍事和能源領域，還與一種古老的生命進化理論有著千絲萬縷的聯系。這種聯系似乎暗示著，晶體可能隱藏著改變生物本質的力量，能夠激發生物潛在的能力。
這個發現讓聯盟和神秘勢力都大為震驚。雙方開始探討如何利用這一發現，但同時也對其可能帶來的倫理和安全問題產生了深深的擔憂。如果這種力量被濫用，可能會導致不可控的生物變異，對整個世界的生態平衡造成災難性的破壞。
在研究過程中，聯盟中的一位年輕科學家提出了一個大膽的假設：晶體可能是來自外太空的產物，是某個古老外星文明遺留下來的能量源。他認為，如果能找到更多關于這個外星文明的線索，也許就能更好地理解晶體的本質和用途。
這個假設引起了廣泛的關注。聯盟和神秘勢力決定暫時擱置對晶體能量直接應用的研究，轉而尋找與這個外星文明相關的證據。他們開始在全球范圍內搜索古老的遺跡、神秘的符號以及任何可能與外星文明有關的蛛絲馬跡。
聯盟的考古團隊在一個偏遠的沙漠地區發現了一幅巨大的古老壁畫。壁畫上描繪著一些奇異的生物和發光的物體，這些物體的形狀與晶體極為相似。通過對壁畫的分析和解讀，他們發現這可能是古代人類目睹外星文明與晶體接觸的記錄。