因為磨勘法已經被大臣廷議通過，不可能輕易改變。如果皇帝真的把匠官定為雜流出身官員，按磨勘法遷轉，他們沒有阻止的理由。那樣文官就會面臨三千匠官的競爭，少去很多官位。
可以說，朱由檢是通過漫天要價，無中生有地創造條件和群臣做交換。
這對朱由檢來說實屬無奈，誰讓他先前沒注意傳奉官，把任命傳奉官的路子直接就堵死了。不創造個新條件，怎么讓群臣同意他對文思院的調整。
所以，在爭執一番之后，朱由檢獲得了對文思院的處置權，決定道：
“前朝有少府，掌百工技巧之政。”
“朕有意成立少府寺，管轄文思院、織染所、雜造局、柴炭司等。”
“工匠、工坊、廠礦這些雜事，就讓少府寺管。”
“工部要忙于朝廷大政，不能為這些瑣事煩心。”
工部尚書薛鳳翔聽到皇帝這些話，心里咯噔一聲，知道皇帝對工部的調整終于來了。如果他不同意，可能就會以附逆罪名罷官。
這讓他顧不得什么文官立場、世人非議，當即附和皇帝道：
“陛下所言極是，本朝開國之初，太祖就設有將作司，隸屬工部。”
“如今設立少府寺，合乎太祖本意。”
見他這么上道，朱由檢很是贊賞，當即回應道：
“少府寺由工部督導，寺卿和少卿由工部和吏部一起推選。”
“其中至少有一個職位由匠官擔任，內部的屬官也以匠官出身優先。”
這個意思是匠官可以擔任少府寺官員、甚至少府寺卿。群臣本能地想要反對，卻聽袁可立道：
“陛下的意思是說，匠官出身官員，除了少府寺官職之外，不能轉任它職？”
“以后他們也不按磨勘法提升品級，而是看少府寺的官位，是否會有空缺？”
朱由檢就是這個意思，先讓文官配合、把工業化推進再說，以后匠官里面出現大才，他自然會特賜元士出身，讓他們踏出少府寺。
現在嘛，就先給匠官設立少府寺這個大本營，讓他們在里面發育。在文官的配合下，調動各方面資源，把工業技術完善。
同時，朱由檢設立少府寺還有一個考慮，那就是政府的管理辦法不適合用于企業，官辦企業會有很大缺陷。
把工坊、廠礦劃入少府，可以讓它們在一個相對獨立的衙門管轄下，使用不一樣的管理制度。用類似國資委的模式，管理工坊廠礦等企業。
這個考慮，群臣自然不知道。他們只是在皇帝表示不會把匠官任命在少府寺以外后，表示皇帝英明。
只要這三千匠官不按磨勘法晉升、不去和文官搶官位，那就沒有妨礙。文思院劃歸少府寺后，正好把匠官限制在里面。
對于文官來說，這是求之不得的事情。以后的皇帝想任命匠官出身的傳奉官，也能被他們用這個制度，把傳奉官限制在少府寺。
可以說，設立少府寺后，文思院這個被他們視作大害的機構，再也不會成為大害。
這種把匠官傳奉官絕根的大好事，群臣當然很歡迎，他們紛紛表示，認同少府寺成立。
朱由檢為了防止他們反悔，還在朝會上投票。讓他們同意設立正三品衙門少府寺，把工部的文思院、皮作局、鞍轡局、顏料局、織染所、雜造局、柴炭司、易州山廠，以及南京的文思院、織染所，還有大通關提舉司、龍江提舉司、清江提舉司等造船機構，都劃歸了少府寺。