莉莉絲的軀體在太空爆炸開來，額頭分為左右一半沉在血紅色的大海里。
碇君，我將粉碎，碎散，降臨而灌注在萬物之中，然后靜靜的等待著你的歸來……
雪花落在地球上，大雪皚皚覆蓋房屋，高樓，樹木，車子……
真嗣從海水里浮起來，他看到對岸的爸爸媽媽。
碇唯一臉欣慰看著自己的兒子，對他說：“真嗣，謝謝你想起對我的承諾。你可以放心，有人會把所有的生命都有邁向復原的力量。萬物自有求生的力量，夢境潛藏在現實中，而現實投影在夢里。最后……
真實會來到心里一個人的行程，是有他的心所造成。當人們能夠用自己力量去想象自我，那么人人都能恢復人的形貌。
我會看著你，而我從今以后，永永遠遠在你存在世上的每一天，即使你死了，又誕生到世間來，我都會靜靜的，遠遠的看著你。
活下去，活下去，讓自己的腳站起來往前走，不要怕，只要有太陽，月亮和地球，你就可以的……”
真嗣看著慢慢消失的父母，內心不再孤獨和難過煎熬：“再會了，爸爸媽媽……”
“真嗣，該和我重啟這個世界了。”
一道熟悉的聲音從真嗣身后傳來，真嗣回頭一看正是黃哲田！
真嗣興奮的對黃哲田問道：“哲田君！你怎么也來了？！”
黃哲田拍了拍真嗣的肩膀說：“畢竟你母親委托我的事，我還沒有完成。后面的就交給我了，還有，綾波麗終將會和你再次相遇！”
真嗣抬起頭看向天空，眼神憂傷道：“可是不知道什么時候能和綾波見面。”
黃哲田從深海中抱起沉睡的明日香放在沙灘，對一旁的真嗣說：“我要封印明日香的記憶，重啟后的世界里，她的記憶中不再有我，畢竟一個重新的世界怎么能被以前的記憶給困擾？
她接下來的新生活將是一個完整的，正常的。”
真嗣好奇的問：“那么綾波麗的記憶，還有其他人比如加持先生和美里阿姨呢？”
黃哲田哈哈一笑，解釋道：“綾波麗的記憶會保存好。加持他們啊，有的是緣分，總有一天會撞在一起，只不過沒有記憶罷了。如果有以前的記憶，也是有一段苦的煩惱，還不如重新從剛開始互相認識。”
黃哲田的戰斗服已經破爛不堪，他拿起明日香已經黯淡無光的項鏈，重新修復后滴有明日香血液聯系上，拿著項鏈對沉睡的明日香說：“明日香，我會給你一個全新的世界，它會如你所愿的。你會等我的，對吧？可惜你暫時記不住我……不過這也好”
黃哲田拿起無限手套其中一顆心靈寶石，啟動它來封印住明日香的記憶。
然后把無限手套戴在手上，六顆寶石的能量侵蝕著黃哲田的右臂，但黃哲田依舊神色如常。
他對一旁的真嗣說：“真嗣，我們后會有期。再見（さようなら。）”
黃哲田抬起右手，輕輕打一個響指。
噠——吼！
一片空白……
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德國
“明日香，你怎么會在秋千上睡覺呢？”今日子對院子里的明日香輕喊道。
明日香從秋千上坐起來，揉了揉眼睛對今日子說：“媽媽，我又做了一個很奇怪的夢。跟上次是一樣的呀。”
今日子來到明日香的身邊，輕輕撫摸她的腦袋關心道：“總是頻繁做同一個夢，得去醫院看一看專業的醫生呀。”
明日香牽著今日子的手一邊走一邊問：“媽媽，你說會不會是夢里的那個男孩子在等待我呢？童話故事里也是這么說的。”
今日子哈哈一笑，順著她的話說：“肯定呢，或許他就是香香的心上人哦。”
明日香鼓著嘴巴哼的一聲說：“他打得過我再說，我在夏令營的訓練可不是鬧著玩的。”
一片葉子正好落在明日香剛坐的秋千上，不過很快一陣風吹來，那片葉子隨風而去，不知所蹤。
————————tv版舊劇場版（完）</p>