第一階段完成，第二階段隨之展開。
李居胥對活下來的人馬做了調整，二級、三級、四級和五級獵人，堅守城墻，以戰斗為主，一級、見習獵人和普通人主要充當后勤，輔助戰斗。
清理尸體、殺毒、滅菌、恢復交通等等。
在這些之前，還做了一個動作，清除下水道、排污管道內的嚙齒鼠，這方面李居胥有經驗，通水之后通電，三秒鐘的時間，不知道殺死了多少嚙齒鼠，因為是在下水道內，數量無法統計，效果卻是看得見的，之后基地內，再也沒有大量出現工兵鼠了。都是一些藏在隱秘角落的工兵鼠，冷不丁冒出來，數量很少。
這次清理是地毯式的，徹徹底底，不留死角，因此，也清理出來了之前不曾發現的驚喜，比如，幸存者。
“你們藏得可真夠深的，我們在外面放炮你們沒有聽見嗎？”地下室被打開，張甫看著卷縮在潮濕地上的數十人，一個個餓得跟干尸似的，臉上沒有肉，顯得眼睛格外的大。
這些人為了盡可能減少體力消耗，每天都是躺著，能不動就不動，很多人太長時間沒有說話，聲音都是干巴巴的。
“你們吃什么活下來的？”張甫好奇
然后就看見了隔間內的幾袋面粉和掛面，因為沒有做飯的工具，同時也擔心驚動嚙齒鼠，這些人和著水生吃。
也多虧了地下室通了自來水。
不找不知道，陸陸續續救出來了一千多人，不過，一個個狀態都不好，很多人是被抬出來的，別說走路，坐都坐不穩。
他們也就運氣好沒有被嚙齒鼠找到，否則都會被咬死。
車隊第三趟拉著物資離開，城南的清理工作已經完成，轉移到了城西。感受最明顯的變化就是空氣清醒了，濃郁的令人作嘔的腐臭味基本上聞不到了。
“老祖宗在上，我終于挺過來了，重活一世，老天待我不薄！”曾玄真長長一口氣呼出，長達三分鐘，再吸了一口新鮮的空氣，通體舒泰。
他走出城外的時候，不少人如見鬼魅。
“曾屠夫，我沒看錯吧，不是說他死了嗎？尸體都腐爛了，這是人是鬼？”
“我去，竟然還活著！命可真大。”
“不科學啊，我記得他是最早感染瘟疫的人之一，不是說第一時間就送去火化了嗎？難道傳言都是騙人的？”
……