在當眾明確完東海鎮海軍編制后，趙宗武做的第一件事，就是對海軍麾下武將重新進行分屬。
遼東軍區基地、扶桑軍區基地、琉球軍區基地，擔負著不同的職責，這也就使得每一位海軍將領必須發揮應有的本領。
范天雄作為遠征倭島的一把手，與駐扎倭島的李旦有很大關聯，因此扶桑軍區基地的總負責人必須由范天雄擔任。
為確保東海鎮海軍能有更高效的發展，趙宗武借助此次機會，也對海軍武將官階進行了的調整。
根據他們的功勛、資歷、年齡來作為衡量標準。
以曹文詔、范天雄、賀虎臣、金冠、吳涇周為首的五人充任海軍副指揮使。
以周遇吉、左良玉、黃得功、祖寬、季士登為首的五人充任海軍參將。
以張虎星、雷苞、祖澤潤、馬新、顏思齊為首的五人充任海軍副參將。
以祖可法、金士麒、王來聘、徐彥琦、楊天生、李斌、趙宗虎、趙宗寶、陳衷紀、李國助、鄭芝龍、鄭芝虎為首的十二人充任海軍游擊。
余者諸如祖澤洪、祖澤源、劉興賢、劉興邦、祖澤沛、祖澤盛、祖澤遠、祖澤淳等一系列武將充任海軍都司、千總、把總等職。
東海鎮海軍經歷重重發展，從無到有完成了驚天銳變，為了確保東海鎮海軍麾下武將擁有較強的戰力，趙宗武便整合所有重新進行調整。
以遼東軍區基地作為新兵組建區域，以扶桑軍區基地作為練兵練軍區域，以琉球軍區基地作為外拓鎮壓區域！
此次回歸的倭島遠洋艦隊，超半數以上將會調撥到琉球軍區基地，通過這樣的方式，徹底杜絕紅毛鬼、黃毛鬼北上，并且為下一階段進軍南洋區域奠定基礎！
既然趙宗武他想要完成大航海時代，那么掌握南洋區域的咽喉要害，馬六甲海峽就是重中之重！
為此趙宗武便敲定了以下名單。
范天雄、曹文詔充任扶桑軍區基地副指揮使，轄下參將左良玉、黃得功，副參將祖澤潤、顏思齊，游擊徐彥琦、金士麒、趙宗寶、李國助、鄭芝龍、鄭芝虎。
金冠充任遼東軍區基地副指揮使，轄下參將季士登，副參將馬新，游擊李斌、祖可法，都司祖澤洪，千總祖澤源、劉興賢、劉興邦，把總祖澤沛、祖澤盛、祖澤遠、祖澤淳。
賀虎臣、吳涇周充任琉球軍區基地副指揮使，轄下參將周遇吉、祖寬，副參將張虎星、雷苞，游擊王來聘、趙宗虎、陳衷紀、楊天生。
以上根據位列明確排序。
既然是發展海軍勢力，那么不單單要讓更多的海軍將士得到歷練，同樣也要確保核心海軍體系的完整。