第四次忍界大戰,日向寧次為保護鳴人和雛田一命嗚呼之后,靈魂莫名奇妙的被拉入了輪回空間,在經歷諸多磨難之后,終于成為了最高權限主神代行者,自身修為也達到了金仙頂峰,距離掌控主神只差一步之遙!只要完全掌控主神,日向寧次就能夠突破至大羅金仙,從此宇宙滅而我獨存。
不料在關鍵時刻,遭到了元皇蘇孟,,無上自在天魔王呂樹,邪天帝方平,奧法之祖路西恩.伊文思,不敗愚者克萊恩.莫雷蒂等一眾大能的狙擊。
日向寧次一怒之下燃燒自身用出獻祭大道的大獻祭法燃燒宇宙本源,提前激發宇宙末日,以此逼迫敵人退卻,無奈敵人眾多,大陰陽仙尊日向寧次魂飛魄散。
僥幸主神護住日向寧次的一縷殘魂,通過時空長河回到日向寧次的少年時代。