兵不血刃的解決了內亂，孫策卻沒時間慶祝。配合蔡邕加快袁術的喪事進程，在諸將拜祭后入殮，看著袁術被裝進棺槨，安排雷薄、陳蘭護送袁術踏是返鄉之路，那邊就開始履行職責，安排宛城的防守事宜。
雖然沒殺人，但該處理的還得處理。陳瑀跑了，孫策沒有安排人去追，暫且放他一條生路，剩下的人卻一一處置。袁術原本就不是個會用兵的人，手下雖多，但真正能打的有限，正好借此機會整頓一番。
張勛留下了，但他自己很識相，堅決要求交出兵權。孫策答應了，請他出任長史一職。長史是武職，名義上可以統領兵馬，但大部分時候只是幕僚首席，并不直接掌兵。張勛改任長史，既奪了他的兵權，又給他保留了名份，照顧他的面子，安撫人心。
閻象官職不變，還是主簿，但孫策對他的信任和支持回予了足夠的回報，讓他兼領南陽太守。
其他諸將也各有變動，除了離開的人之外，離下的有一部分保留原職，但大部分的兵權都被剝奪了，轉為閑職。其實就算孫策保留他們的兵權也沒用，與陳瑀一起叛亂，與南陽豪強談判，出賣部下將士的利益，他們已經失去了將士的信任，在軍營里呆著反而不安全，不如做個閑人，避避風頭。
如此一來，有近三萬大軍要重新分配。
孫策首先精選了一萬士卒充實到自己的中軍，親衛營增加到四千人，黃忠、鄧展、董聿和秦牧四部各增加一到兩千不等。這和各人的能力有關，能力強的就多給一些，比如黃忠、鄧展，每人各領兩營四千人；能力弱的就少給一些，比如董聿、秦牧。他們都比較年輕，剛剛統兵，帶兩千人已經吃力了，兵力再多就指揮不靈，反而壞事。
然后孫策又精選了一萬人撥給周瑜。毋庸置疑，周瑜是這次平叛成功的第一功臣。孫策毫不吝惜地給他重賞，而最好的獎賞無疑就是給他壓更多的擔子。周瑜帳下原本有三個校尉，三千多人，有了這一萬人，他的實力一下子翻了兩番，成為僅次于孫策本人的重將。
孫策又挑出兩千南陽本地人，讓他們帶著糧食，追趕文聘，增援武關。文聘之前帶走了萇奴的人馬，加上這兩千人后，他就擁有了兩個營，接近四千人，與黃忠、鄧展并駕齊驅。
剩下的人不是老弱，就是太年輕，或者身體素質較差，孫策將年老體弱的遣散，戰力差的整編，有技術的編入輜重營，年輕的單獨編為童子軍，平時做做雜務、后勤，戰時編入預備隊。
整軍的同時，閻象發出了第一份太守令，行文各縣，一是宣告孫策對荊州的統治權，二是警告各縣西涼兵將至，讓各縣做好防守準備。周瑜說得很清楚，別看孫策控制了宛城，是名義上的荊州牧，但他的政令基本上很難超出宛縣的范圍，閻象這么做也是盡力而為，至于各縣聽不聽他的，說實話，誰也沒數。
兩天后，雷薄護著袁術的棺槨起程，袁權、袁衡姊妹同行。孫策到城外送行，依依惜別。袁權摟著袁衡坐在車上。袁衡偷偷地看著孫策，卻不敢與孫策的目光對視。
袁權卻很坦然地看著孫策的眼睛。“我們姊妹在汝陽老家恭候將軍的捷報，送先君入土。”
孫策拱手施禮。“擊退徐榮，我就趕到汝南，為將軍扶棺培土。”