第3新東京市。
遭遇N2地雷正面爆炸的水天使（作者菌習慣這么稱呼）經過個把小時的沉默，已經完全自愈了傷勢，再次恢復了行動。
從登陸以來，水天使的行進路線并非一條直線，而是沿著某個方向不斷尋找，不過如今它終于確定了目標。
那是第3新東京市的核心地帶，與之前展開戰斗的郊區不同，這里高樓林立，建筑密集，與人口稀疏的郊區不可同日而語。
還好這畢竟是末日之后重建的新都市，十五年前的那場沖擊直接導致了全球一半人類的死亡，如今重新新建立起來的要塞都市別的方面還好說，對于避難建筑的投入是絕不吝嗇的。
更何況這里還是第3新東京，絕對算是這個世界的核心地帶了。
因為就在這片大地下方的那個巨大地底空間的最深處，存在著那些名為使徒的生物絕對不會放棄的最終目標。
第3新東京市，這是由NERV所在地的日本提出執行的《第3新東京市遷都計劃》下的產物。其地理位置在相模灣邊，神奈川、靜岡兩縣交界附近的箱根山上。鄰近不遠處有新小田原港，離海岸線不遠。不過畢竟是建立在山嶺之上，所以都市附近都還是一派山林景色。
不過，所謂遷都計劃，其實只是個幌子。它真正的目的是要建立一個專門用以對付使徒的決戰場。因此第3新東京市在設計之初，即被塑造為一個要塞都市，其主要建筑物在必要時都可以降至地下，市民避難設施也特別齊全。而且，在戰斗狀況發生時，還會從地下冒出戰斗支援用偽裝建筑物對EVA機器提供支援。在它的地表建筑之下，有個直徑六公里左右的巨大地下空間，NERV總部就設立于此處。
地下都市，這里才是第3新東京市的真正核心，是一個直徑6公里、高0.9公里的半球狀巨大空洞，也是NERV總部之所在地。這本來是一個球形的地下空間，但因沙土堆積而掩埋了大部分，只剩下上部的空間。NERV總部的多數設施都建在這些沙土之上，也有部分埋于下面。其中使徒的目標可能就位于球形的底部。
若是說第3新東京市是個要塞都市的話，那么這里就是要塞的內部了。相對于地面上多半用于軍事用途的建筑物，這里則是一般市民的主要收容所。
為了防范使徒的直接攻擊，這里和地面之間有著多達22層的裝甲板。在一些合適的天氣里，地下都市通過地上的圓形集光建筑用光纖將自然光送到地下。
而如今，水天使已經發現了地下空間的存在，并且正在試圖突破地面之下隱藏的層層裝甲真正進入此處。
轟然震爆之聲充斥整個地下空間，那是使徒展開全力攻擊的強力手段，從兩個眼洞中發射的光炮威力驚人，雖然沒有核彈或者N2炸彈那么大的影響范圍，但是威力更為凝聚，非常適用于攻堅戰。
水天使的第一炮打在了城市地表區域的外圍，炸開的十字高能沖擊掃平了大片地表城區的樓群，卻并沒有真正波及要害，僅僅只是引起了地下都市的震動。
第二炮卻已經轟擊到了地下都市的表層裝甲，不過未能找準方位，只是引發了邊角區域的大火。
敵人已經近在咫尺！
碇真嗣雖然差點被父親的逼迫和無情給整到崩潰，但是當那個躺在病床上的凄婉身影出現在眼前，一種不可名狀的感覺從少年的心底彌漫開來。