到這時候，北京城哪里還能守的住？早就潛伏的錦衣衛探子不僅在城中鼓動混亂，而且分出手里直接收買了城中守衛之兵，最終第一道打開的城門并非是明軍一直猛攻的朝陽門，也不是同樣進攻的東直門，反而是靠近兩門的東便門。
當東便門一開，明軍趁勢而入時，北京城徹底失去了最后的防御，守城將領見大勢已去不是自殺就是化妝而逃，而那些守城的士兵們除投降者外，其余亂兵在城中四處亂竄，瘋狂搶掠，企圖趁亂撈一把就走。
明軍進城第一件事是先控制北京九門，然后以隊為單位展開，逐一進行清剿工作。
由于有錦衣衛做接應和帶路，清剿異常順利，一路推過去，明軍用大喇叭宣告普通百姓一律全部閉門在家，不得外出，而在外的人除老弱婦孺之外，青壯不跪地放棄抵抗者一律全部射殺。
這時候是不能講仁義，道心軟的時候。北京城的治安平定必須要用雷霆手段，以最快的速度掌握整個北京城。
明軍以戰斗隊形層層推進進行清剿，但凡沒有跪地者就是一陣排槍過去，打得對方千瘡百孔再說。至于跪地者，一些一時間沒來得及趕回家的老弱婦孺暫時找地方收容，而其余人全部捆了后押至一旁。
一時間，北京城中槍聲四起，到處都有中槍的慘叫聲，老百姓們嚇得躲在家中門板后，透過門板的縫隙膽戰心驚看著街上這血腥的一幕。有些膽小的人，當場就嚇尿了褲子，至于那些孩子們，更是被家中大人驚恐地捂住嘴，生平哭喊出聲給自家引來禍事。
“大帥，可以進城了。”當城內的槍聲逐漸稀落，前鋒部隊派人回報，北京城已在明軍的控制之下了。
“這可是我大明故都，天子之城，莊兄，我們一起進城吧！”林建章笑呵呵地指著面前的北京城道。
莊巖同時眺望著已經大開的城門，心中感慨萬千。
同林建章不同，莊巖原本是清廷官員，俘虜后才入的明軍，而現在僅僅幾年過去，他怎么都沒想到大明就能以這種方式拿下了故都，進入了北京城。
兩人騎上馬，由朝陽門而入，按照北京九門的含義，出征走德勝門，凱旋歸來走安定門，但由于他們僅僅只是統兵大將而并非朱怡成授權，再加上明軍大營靠近朝陽門，如果再繞道未免不便，所以為了考慮這些因素還是走的是朝陽門。
此時，北京城內已基本安定，就連紫禁城也都在明軍的掌握之中。兩人入城后先去了紫禁城，但他們只是視察一番，然后交代了些守衛宮禁的要求并未入宮。
雖說將在外君命有所不授，但對于紫禁城不入宮還是必要的，畢竟這是皇家故地，臣子擅入罪過不小，無論林建章還是莊巖絕對不會在這種事上犯下錯誤。