四月下旬至五月上旬，朱慈烺巡視了蘇州府、松江府以及湖州府，圍繞著太湖水系視察沿岸諸險，臨閱河工。
太湖是中國五大淡水湖之一，河港縱橫，河口眾多，有主要進出河流五十余條，連續七年的崇禎大旱，呈現了北旱南澇的格局，旱災旱區逐年向東、南擴大。
每逢夏季，太湖周邊的湖州府、蘇州府等地便出現了特大暴雨，進入看海模式。
崇禎十三年后，北方降雨增多，轉變為北澇南旱，在這期間蝗蟲災害猖獗，瘟疫開始流行......
南直隸太湖地區有耕地一千多萬畝，受到天災的影響極大，若不是現任南京戶部張國維，主政蘇州期間曾經建蘇州九里石塘及平望內外塘、長洲至和等塘引水，恐怕水患將會更大。
太湖水系湖蕩眾多，河網密集，引水蓄水條件優越，只是朝廷沒錢修堤引渠，不能及時的治理，導致建閘啟閉不靈，引排失時，小潮引不進，大潮引不足。
朱慈烺帶著熟悉江南河道的張國維幾人巡視了一番后，決定從稅務部撥銀五百萬兩用于治理江南河道，力爭將江南之地變成“低田常無水患，高田常無旱災”的景象。
為防止以往地方官的貪污現象，朱慈烺任命新晉官員閻應元為江南總河大臣，陳明遇、馮厚敦輔助，掌管江南堤防、疏浚之事。
歷史上的抗清三公在江陰聯手抵抗二十四萬清軍高達八十一日，現在朱慈烺讓他們聯手抗洪，看看究竟是八旗軍厲害，還是洪水厲害。
五月二十日，南巡大隊到了杭州。
黃土鋪墊的官道上，明黃綢帶飄揚，鼓樂生蕭合嗚，禮炮轟得震天響，浙江巡撫楊廷麟和總兵黃得功二人，親率浙江文武百官出城十里迎接。
這個杭州城都沸騰了，人人齊集街頭，萬人空巷，誰不想瞻仰一下太子出巡的排場和風采，誰不想看看一聲令下殺得人頭滾滾的狠太子？
攤丁入畝減輕了百姓的負擔，廢除衛所制更是讓許多軍戶得到了自由，尤其是一些被廢除賤籍的浙江惰民，更是激動得熱淚盈眶，朱慈烺途經之處，人人頂禮謨拜，一片“千歲、千千歲”的歡呼聲。
朱慈烺身穿大紅朝服，端坐在儀仗內，不禁被這個場面感動了。
眾官員簇擁著朱慈烺來到了杭州巡撫衙門，接受百官朝賀。
演禮已畢，楊廷麟恭恭敬敬地走上前來，行大禮道：“臣楊廷麟，參見太子殿下千歲！”
朱慈烺笑著道：“楊卿在巡撫浙江還習慣嗎？本宮將你從南京吏部調來浙江，你心中有沒有怨言？”
楊廷麟忙道：“臣為太子殿下辦差，不敢有怨言！”
朱慈烺點點頭，道：“本宮沿途聽說你在浙江嚴厲推行新政，獲得當地百姓的一致好評膜拜，你的官聲不錯嘛！”
楊廷麟連忙跪拜道：“殿下明鑒，浙江百姓淳樸，但臣絕不敢生受百姓謨拜，新政是殿下推行的仁政，臣不敢邀功。”