三號機已經炸了，二號機這邊還在被封印，并且駕駛員之前是明日香，現在就算想選新的也不是那么快的，根本用不了。零號機這邊呢，綾波麗最近的狀態實在是不行，同步率一直都處于能啟動的最低水準，好像隨時就會發生意外一般。
而本來駕駛員中表現最好的，同步率最高的碇真嗣，現在也出現了問題。簡單的說就是他尥蹶子不想干了。
這方面倒是和原著的情況差不多，被傀儡系統控制的初號機也是發了瘋一般的攻擊三號機，不過區別就是三號機這邊因為被崩玉影響出現了變異的關系，導致實力要比原著中強得多，所以初號機并沒有直接將它撕了，但是這種違背碇真嗣的意志強行出手，甚至過程中碇真嗣一直都在懇求父親停手，碇源堂也沒任何回應的行為還是徹底的惹怒了碇真嗣。
從林頓的角度當然也是很能理解碇真嗣這邊的反應，就是你寫信說有事拜托我讓我來的第三新東京市，過來就突然讓我開EVA。勉強接受了這樣的設定，結果突然你又說開發了一個傀儡系統來代替我，合著卸磨殺驢過河拆橋呢？就自己只是個智能駕駛之前的工具測試員唄，現在傀儡系統出來自己是不是也已經不重要了？
所謂期望有多大，失望就有多大。碇真嗣之前對自己的父親抱有期望，還想要做些事情得到父親的認可，但是傀儡系統就是對他所有努力的完全否定，可以說是碇源堂捏著他的臉在告訴他我更加信任機器操作，而不是你。
在這樣的打擊下，碇真嗣直接都自閉了。從初號機上下來之后的第一句話就是，“我再也不要駕駛這樣的東西了”。很明顯對于這樣的情況，碇真嗣的選擇就是逃避，而不是去證明什么我比智能系統有用之類的，這當然也是他的性格使然，遇到痛苦的時候，反正先閃開再說。
當然碇源堂這邊肯定也不慣著他啊，不開你還留在NERV干嘛，直接給我滾蛋。而這邊的碇真嗣的回答大概也就是滾就滾的意思，根本沒有絲毫的留念。此時這邊的碇源堂大概也是對傀儡系統有些盲目的自信了，或者覺得自己并沒有必要和碇真嗣妥協什么，不僅沒有挽留的意思，甚至當場就下令注銷碇真嗣的駕駛員資料。
和碇源堂談完之后，碇真嗣算是徹底的失望了。他決定離開第三新東京市，至于什么使徒毀滅世界的事情，他不想管了，毀滅吧，趕緊地，累了。
此時唯一想要挽留碇真嗣的人大概就是葛城美里了，也是的她把目前碇真嗣的情況告訴給林頓的，本來的意思大概是想要讓的林頓這邊幫忙想想辦法，但是林頓這邊本來也就不想管這件事。
“這還真的是開家長會談了嗎？”林頓笑著說道，現在的情況，他和葛城美里就像是兩個家長分別管著自己家的孩子，然后葛城美里家里出了點問題找他來商量下怎么辦的感覺，“你那邊就不能自己想想辦法嘛，我這邊可是也是忙的要死啊，我家兩位一個會噴火，一個正在努力的噴激光……”
“所以都說了我根本不會噴激光！”旁邊的明日香直接吼道。是的經過兩天的檢查，這邊的明日香現在已經算是“出院”了，本來她就沒啥事，這兩天都在配合檢查而已。之前說了NERV這邊現在沒辦法鬧翻，最后也只能放人，當然監視之類肯定是有的。
他們倒是也沒和明日香明說以后不能駕駛EVA之類的，只是簡單的說要觀察情況再說。但是明日香并不是白癡，目前的情況她大概還是能猜到一些的，但是出乎她自己的預計的是，明日香發現自己的失落情緒并不是那么大。