墨菲享受了不到兩天的時間，救世主尼奧又一次站在了自己的面前，這個速度不能說快也不能說慢，畢竟雙方之間是戰爭，每時每刻都有人類死亡，而‘矩陣’一方死亡的不過是機械體罷了。
墨菲不知道發生了什么，為什么尼奧又來了，這個對于他來說并不滿意，也不知道他的能力有沒有體現在現實中？
“你來的到是很快，不過我想知道你在現實中是否有什么不同呢？”墨菲歪著腦袋上下打量著尼奧，隨后問道。看不出來，畢竟這里是虛擬世界，尼奧依然是原來的樣子，墨菲只能問問了。
“你怎么知道我在現實中會有變化？你對一切都很了解嗎？”這次尼奧也是疑惑的很，對方好像知道的很多，一切都好像是他在掌控之中一樣。
“知道的不少，需要的更多，解釋就不用了，讓我看看你又有什么變化，敢于再次出現在我面前？”墨菲可沒有給對方解釋的義務，他現在想要知道尼奧在現實中是否有了變化，自己怎么才能得到這種能力？
尼奧擺出了架勢，但是墨菲并不看好在虛擬世界中他和自己戰斗，對方必然有什么想法，不然不會這么明目張膽的站在自己面前。
墨菲思考了一下，‘是第三部中干掉史密斯的方式嗎？’
第三部中史密斯在虛擬世界也算是無敵的存在了，尼奧被打的半死，隨后被史密斯同化，而此時是‘矩陣’幫助尼奧進行連接，隨后‘矩陣’加大能量的輸入，通過尼奧的身體進行傳遞。不過傳遞的能量還是病毒不得而知，史密斯從內部開始崩潰，隨后全部消滅，虛擬世界恢復了正常。
墨菲笑了笑，如果是這樣的方式，沒準自己不用去找‘矩陣’的端口，直接通過尼奧就可以將他們兩個同時抓住，試試吧！
尼奧沖了過來，不過和上次沒有什么區別，墨菲輕松的抓住了尼奧的拳頭，“你沒有什么進步啊，是誰給你的信心再次挑戰我呢？”自大的表現是一定要的，畢竟對方也不傻，演戲就要演的專業。
墨菲輕松的完虐著尼奧，抓著他的拳頭不斷的摔打著，掄起來砸向地面，遠方的墨菲斯和崔妮蒂看的一陣揪心。
……
墨菲斯的飛船沖向‘矩陣’的主機位置，這需要莫大的勇氣，迎面而來的是鋪天蓋地的機械章魚，另外還有大型的戰艦，他們就像是海洋中的一葉小舟。
大家抱著必死的決心進行沖擊，尼奧不負眾望的在現實中掌握了能力，死亡的威脅讓他有了突破，不過他們的力量太小了，根本無法對抗‘矩陣’，飛船墜毀，尼奧面對‘矩陣’提出了計劃。
‘矩陣’最后同意了，墨菲的威脅對它來說太大了，畢竟他不可能放棄虛擬世界，飼養的人類需要一個精神世界，這樣他們才會在里面沉睡而無法自拔。而‘矩陣’在虛擬世界中無法定位墨菲的位置，即便墨菲就站在那里進行破快，它都找不到墨菲。
于是尼奧再次來到墨菲的面前，他是要犧牲自己，讓‘矩陣’可以采取現實中的手段對付墨菲，當然他們不知道墨菲到底是什么，為什么這么強大，但總是無法逃脫一個規律，墨菲是一個程序，他們如此判斷。