劉元昭也沒急著行動，先是在烏思藏都司開展農奴解放運動，硬性規定烏思藏的貴族將自家的農奴釋放。
那些頭人十分不滿，意圖反抗，劉元昭毫不手軟，將那些已經思想改造一番的奴兵派到了烏思藏都司。
他們殺起頭人那是毫不手軟，嚇得其余的頭人們不敢再對抗，當即釋放自家的農奴，向劉元昭表示臣服，成為普通百姓，只有部分有才學的子弟參加官員選拔。
農奴運動解放之后，藏傳佛教回歸正途，接受帝國官員監督。
劉元昭攻打陜西計劃停止，一身心的撲到西部大開發中。當然挑撥后金與大明之間的關系這件事，他一直沒停下。
今年的二月十三日，孔有德率叛軍近萬人突圍，棄城登船而逃。
駐守在旅順、長山、鹿島的明總兵黃龍，預計孔有德兵敗后必經長山、旅順而投奔后金，早已嚴陣以待，周文郁等也窮追不舍。
孔有德部在旅順一帶登陸后，黃龍率兵伏擊，擒獲孔有德部將毛有順、毛承福等人，大敗叛軍。孔有德、耿仲明等率余部逃到蓋州。
這時的孔有德狼狽不堪，手下士氣渙散，嘩變就在眼前，為了活命，孔有德與耿仲明一商議，決定投靠女真人。
于是他們給后金送去了一份乞降信，信中說了明朝主幼臣奸，又說他們這些武夫過得十分悲慘，士兵們都是食不果腹。
然后說了登州之亂，又說自己甲兵數萬，有堅船利炮等等，希望皇太極可以收留。
這件事情對于皇太極來說，誘惑很大，孔有德手中有他急需的一切。
范文程卻說道：“大汗，明國京師傳言，孔有德叛亂都是大金出的主意，原因在于貪圖孔有德麾下的炮兵戰船等東西。
大汗要是收留了孔有德，這是跳進黃河也洗不清了，到時候，恐怕會影響兩國關系。”
阿濟格冷笑道：“這有什么？明國太弱了，誰都可以打他一下，搶他一把，而現在的明國連自己的叛將都解決不了，還不如乘機滅了明國！’”
其余人聞言都點了點頭。
范文程進言道：“劉元昭的實力越來越強了，他與明國的矛盾也越來越尖銳，不可調和，奴才覺得，大汗還是要等劉元昭與明國拼的死去活來的時候再出手。
而且，奴才覺得可以和明國內的流寇聯系，支持他們奪取中原正朔，這般，他們也會和劉元昭起矛盾。大汗，此時入手，是不是早了？”
蒙古爾泰怒道：“你這奴才，話里什么意思，難道我女真八旗還怕了劉元昭不成？他劉元昭不過是火炮犀利而已，若不是如此，怎可與大金爭雄？”
范文程還想反駁，皇太極擺手道：“孔有德要收，他手下的工匠和炮兵都是我們大金需要的。至于明國的態度，就那樣吧。”
范文程一聽，很識趣的閉上了嘴巴，他明白皇太極已經有了決定。
四月，孔有德率叛軍及家眷10000多人在鴨綠江口與濟爾哈朗、阿濟格、杜度率領的后金兵會合，孔有德他們被要求剃發，登萊之亂遂告結束。
由于孔有德帶來了后金急需的艦隊、紅夷大炮及匠人，所以皇太極對他們的投降極為重視，親率諸貝勒出盛京十里迎接，并使用女真人最隆重的“抱見禮”相待，仍以他為都元帥，安置東京（遼陽），自成一軍，稱“天佑兵”，給予特殊待遇，隨后便引后金兵攻占黃龍所在之旅順。
崇禎被皇太極這一舉動激怒，特別是京師里的流言再度塵囂而上，這讓崇禎對于女真人的聯盟嗤之以鼻。
不過馬市的稅收讓崇禎手中寬裕了許多，為了懲治皇太極的背盟行為，崇禎讓東廠監察與女真互市的馬市。
其中火藥，鐵器等物資禁止貿易，最后就剩下一些奢侈品出售給女真人。
徹底關閉不太可能，崇禎需要這馬市的稅收。