李慢侯退休前，就極力阻撓林木部和女真勢力的勾結，李睿親自出面，跟林木部族達成協議。可是林木部族陽奉陰違，我行我素。李睿大權在握后，認為這是極大的威脅。女真人在西方發展已經無法控制，一旦讓他們跟林木部結盟，重返漠北的話，漠北勢必變天。
于是幾次三番警告無果后，李睿決定動手。聯合漠北三部、白韃靼部，并從遼東征募了二十萬騎兵，向林木最大部族蔑兒乞部發動了戰爭。這個大部經過兩年殘酷的戰爭后，徹底消失在了草原上。
消滅蔑兒乞人之后，林木部失去了霸主。東藩府決定將林木部納入直接管轄之下，在蔑兒乞人的土地上，北海（貝加爾湖）地區，以蘇武城為基地，建立了北海都護府。負責全面管轄林木部族，轄區北到冰海，西到烏拉爾山，東到流鬼、夜叉國的土地。
在這片廣袤的土地上，北海都護府利用流放的罪犯屯墾，修建了十幾座城池。并且直接接管林木部掌握的森林商道，派去官員進行管理，修建一些基本的道路、碼頭，維護商道正常往來。并在烏拉爾山區，常駐軍隊，修建了幾座要塞，防止女真人和林木部相互勾結。
一個三十萬人口的草原大部消失，這在草原上造成了極其強烈的沖擊。以前李慢侯執政時期在草原上積累的信用，一朝破產。漠北三族依然經常性的參加契丹人的軍事行動，可是已經開始收斂，再也不敢舉族西征，無論契丹人開出什么樣的優厚條件，他們的大汗牙兵始終不會離開部落，他們擔心一旦主力離開，他們也遭到蔑兒乞式的的打擊。草原上開始人人自危，自保心態增加，擴張慾望被壓制。
收縮的草原部族之間，因為人口增加，劫掠收獲減少，互相之間開始爭奪草場，大小戰爭不斷。主要是蒙古人和塔塔爾人之間你爭我奪，雙方圍繞也里古納河展開了反復廝殺，今天你控制了這里，明天我控制了這里，除了仇恨增加之外，沒有任何好處。
克烈人則開始了內斗，他們的大汗不久前死亡，將部族分給了自己的弟弟和兒子，結果兒子跟叔叔立刻爆發內斗。忽兒札胡思的弟弟脫斡鄰勒可汗和古兒汗爆發大戰，先是脫斡鄰勒戰敗，然后向乃蠻部借兵又將古兒汗擊敗。可是雙方誰都沒消滅對方，克烈部分裂，開始了長期廝殺。
除了這些軍事行動之外，李睿集團還像好大喜功的帝王一樣，熱衷于興建各種規模宏大的工程。就在對草原進行征伐之前，他們修建了一條遼東運河。
這同樣是一個不從經濟角度考慮的決策。因為在遼東修建運河，肯定是無利可圖的。
修運河自然會有好處，但這種好處肯定無法彌補投入，就好像在沙漠里修高鐵也有用，但絕對入不敷出。
他們修建一條從松花江跟東遼河之間的運河，沒有任何技術障礙。因為東北平原地勢平坦，兩條河支流之間最短距離就一百多公里，而且分水嶺并不高，即便開山修河，用堤壩儲水都不是問題。
東藩府選擇的方案并沒有翻越分水嶺，而是在松花江干流上直接取水通往遼河干流，即便是干流取水，直線距離充其量五百里，但他們選擇了一條近千里長的曲折方案，因為他們要求自流。兩條河流之間，是遼闊的松遼平原，海拔低、地勢平，但要保持自流，也無法采取直線方案，因此他們大量曲折迂回。