蒲子軒與幼兒妖怪的戰斗發生在浙西，十日之后的六月十六，西元一八六肆年七月十九日凌晨，另一條江蘇戰線上，化名為馮玉良的蘇三娘正傲然佇立于天京城太平門城墻上，女扮男裝，與三千“圣兵”一道，面對著墻外曾國藩率領的湘軍主攻部隊。在滿月與燈火映襯下，其身影如同當初在昆侖山逆境中時那般英悍而挺拔。
之前，蘇三娘聽聞洪秀全死訊，深知太平天國已危在旦夕，從仙劍堂走得急促，早在蒲子軒一行抵達昌化縣六日前，便已快馬加鞭抵達了位于江蘇省太平天國的首都天京。
此時，太平天國的“皇帝”已換成年僅十四歲的洪天貴福，一切軍政事務則統歸忠王李秀成執掌。由于李秀成當年隨石達開征戰安慶時見過“馮玉良”，天京又正是用材之際，蘇三娘無需費力便取得了李秀成及幼天王的信任，以“沙王”之名義率眾死守天京，一晃已殊死抵抗半月有余。
這場戰爭，最終攻城決戰雖尚未開始，其整個歷程，從西元一八六二年三月曾國荃部離安慶東下算起，已然持續兩年有余。
一八六二年到一八六三年的五月，蘇三娘正隨著石達開在西南地區開疆擴土，后遇到妖王犀渠強勢介入，敗走大渡河。而在江蘇主要戰場，洪秀全及一干將士也是獨木難支，其控制領土不斷被清軍蠶食。
一八六二年五月，湘軍攻占當涂、蕪湖、板橋、秣陵關、大勝關、三汊河，直逼雨花臺后，天京便已處于湘軍直接威脅之下。
七月十一日，西南屏障安徽省寧國府被攻破。楊輔清、洪仁玕從皖南回援天京，夜襲湘軍不敵。
之后的一年多，洪秀全雖命李秀成反擊，又占領數座城池，企圖分擔天京壓力，然而由于糧食短缺、湘軍增兵，李秀成又不得不于一八六三年六月率部由九洑洲南渡返京勤王，一路戰死餓死者達十萬人。此時，石達開在成都公堂受審，慷慨陳詞，令主審官崇實理屈詞窮，無言以對，后從容赴死。
九月，曾國荃部攻占天京城東南的上方橋和城西南的江東橋，十一月又連續攻占了城東南的上方門、高橋門、雙橋門、七橋甕以及秣陵關、中和橋，太平軍在紫金山西南的要點全部失守。此時，蘇三娘已在鳳洲島遭遇伏魘奪取記憶，無力回援。
一八六肆年二月，湘軍攻占了紫金山巔的天保城。三月，曾國荃部合圍天京之后，用云梯攻城，被天國守軍擊敗。
五月，蘇三娘隨仙劍堂在廣西死戰秦邕時，洪秀全預感大勢已去，又在天京城內修筑“月城”，已供城破之后作最后的抵抗。
此時，圍城的曾國荃湘軍只有七萬人，太平天國守軍還有十四萬“圣兵”，忠王李秀成力諫洪秀全棄城，洪秀全將其痛罵后，進一步采取了全民皆兵的策略，宣揚上帝會來拯救天國，又團結起了軍心，讓湘軍屢屢嘗試攻城戰卻無功而返。
就在滿城軍民看到一絲生存曙光之際，六月一日，洪秀全，這位太平天國的締造者，十四年來的精神領袖，突然病亡，享年五十歲。
那之后的天京城，盡管已聚集了太平天國幾乎全部的剩余正規兵力三萬人，民兵數以十萬計，卻深深醒悟，這位號稱上帝之子的領袖原來也不過一介凡人之身，頃刻之間，多年來用于凝心聚力的拜上帝教信仰轟然倒塌，士氣跌落到了谷底，能戰之兵力不過三四千，只得秘不發喪。
但曾國藩十日之后到底還是探明了洪秀全的死訊，開始大量調兵遣將，準備對天京城發動總攻，七月十九日凌晨，于太平門東側事先挖好的地道內安放地雷轟炸城墻，天還未亮便將城墻轟塌，兩軍開始了血肉橫飛的肉搏廝殺。
這長達兩年的戰爭，被稱為“天京保衛戰”。
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……
“贊美上帝為天圣父，贊美耶穌為救世主，贊美圣神風為圣靈。真道豈與，世道相同，能救人靈，享福無窮。智者踴躍，接之為福，愚者醒悟，天堂路通，天父鴻恩，廣大無邊，不惜太子，遣降凡間，人知悔改，魂得升天……”
能戰之圣兵，一邊吟誦著最后的《圣父贊美經》，一邊用刀槍守護著生命最后的防線，讓湘軍縱使能上得城墻也難越雷池一步。