大概在1973年就是逆轉未來的羅根回來的時間點了，羅根是否回來決定著魔形女瑞雯·達克霍姆是否殺了玻利瓦爾·特拉斯克。
如果殺了玻利瓦爾·特拉斯克時間線正常的話就應該是羅根在逃亡中的時候對自己天生的異能感到既恐懼又厭惡，于是自暴自棄。
直到有一次，他在森林中偶遇并且愛上一名印第安血統女子“銀狐”凱婭。
凱婭后來被金剛狼的哥哥維克多（劍齒虎）所殺，憤怒的金剛狼決定接受史崔克將軍的條件，同意進行變種人的改造實驗。
羅根給自己起名為“金剛狼”，并且本身骨骼被改造成不可摧毀，天生的骨爪變成了金剛爪。
被改造的金剛狼還***武器”組織洗腦，金剛狼蘇醒后殺死了“X武器”組織的人之后逃跑，誰知道劍齒虎此時前來追殺，于是金剛狼與劍齒虎大戰一場，又兄弟齊心打敗了“X武器”組織的最新試驗品“死侍”之后離開。
但是遭到了威廉·史崔克的暗算，喪失了記憶。
大概在2000年的時候美國參議院，辯論一項有爭議的法案，即變種人登記法案。變種人權利倡導者讓·格雷博士在高情緒壓力期間證實了突變性特征如何在青春期表現出來。
她反對該法案。立法由狂熱的，偏見的反突變參議員羅伯特凱利推動-它需要變種人向政府注冊，從而揭示他們的身份和能力。
這份限制變種人的法案得到了查爾斯教授和萬磁王的一致反對。查爾斯教授主張以政治手段解決問題，而萬磁王則要以力證道。
而在加拿大阿爾伯塔省北部，小淘氣瑪麗遇到了金剛狼。金剛狼被認為是一個突變的“怪胎”，當他與心懷不滿和失敗的對手發生沖突，并暴露了他的長刀鋒利的可伸縮金屬爪，從酒吧被趕走。
兩人結伴前行，不料發生了一場車禍。兩人被趕到的X戰警救下并被帶到了X學院。然而小淘氣的能力被萬磁王看中，想要利用小淘氣達成自己的計劃。
魔形女依照萬磁王的命令將小淘氣從X學院擄走，實行了萬磁王的計劃----把整個世界的各國首腦變成變種人。
金剛狼和X戰警一起毀滅了萬磁王的陰謀，然后把萬磁王關在了塑料監獄里。
羅根為了找回自己過去的記憶離開了X教授的學校，隱姓埋名前往艾卡里湖工業中心，另一邊，人類議會正忙于重建在變種人大戰中受到重創的自由女神像，萬磁王則繼續在X教授精心打造的塑料監獄中服刑。
在一次針對美國總統的驚天刺殺行動中，具有瞬間移動和隱性能力的新類型變種人--藍魔鬼的現身，不但再度引起政府和社會上對變種人的抵觸情緒，更掀起了一場來勢洶洶動機不純的反變種人運動。
在白宮內，一向敵視變種人威廉·史崔克將軍與參議員羅伯特·凱利，正與總統籌劃展開針對變種人總部X學院的武力行動。而總統身邊的助手，秘密化名安妮·瑞諾德斯的變種人--死亡女，也有著不為人知的秘密打算。
X教授這邊，金剛狼在艾卡里湖的調查一無所獲，只有先返回X學院助陣。集合了力量的X教授希望通過自己的超能力，找到刺殺總統的新類型變種人藍魔鬼。
但是，藍魔鬼的特殊能力使他散發出的變種人信號非常微弱，連X教授也無法找到他的確切位置，只能模糊地感覺到其人應該身處波士頓附近。