天啟的陰謀遭到正義的X戰警們的頑強抵抗，X教授、魔形女、琴·格雷、鐳射眼、夜行者、野獸、快銀等變種人聯起手來，與這個看似無法阻擋的敵人進行一場史詩對決。
最終天啟被殺，世界被拯救。不過琴·格雷因為使用了鳳凰之力，導致了黑鳳凰的覺醒。
1995年美國的航天發射場，奮進號航天飛機剛剛升空，地面的控制人員在高空檢測到一個類似太陽耀斑的巨大能量，隨即飛船失聯。
美國總統秘密給查爾斯教授打電話，要求出動X戰警前去營救下落不明的宇航員。
查爾斯教授隨即派魔形女擔任隊長，帶著琴·格雷、鐳射眼、藍惡魔、風暴女、快銀、野獸幾人駕駛X戰警的飛船飛入太空執行營救任務。
眾人到了太空看到一大團暗紅色的能量團在大肆涌動，而航天飛機就在能量團的邊緣搖搖欲毀。
藍惡魔帶著快銀傳送到飛機，將座艙內的6名宇航員系悉數救出。但被救出的宇航員說還有一個機長沒被救出。
當時航天飛機幾乎已經被能量吞噬，魔形女因為覺得太過危險不想救剩下的那名機長。
但查爾斯教授堅持要將所有人救出。不得已，魔形女派琴·格雷與藍惡魔再次飛入航天飛機搜救機長。
琴在飛機內用自己的意念力抵抗那股能量維持住飛機的形體，同時藍惡魔去救人。但在藍惡魔將人救出后，那股能量瞬間爆發直接沖向琴，琴瞬間化成一片火海。
為了不讓擴散的爆炸能量傷到X戰警的飛船，琴用僅存的意識將全部的能量導向了自己，瞬間發生了大爆炸。爆炸過后，藍惡魔將琴的“尸體”帶回了飛船。但琴不久后竟然自己蘇醒了過來。眾人虛驚一場。
回到地球，X戰警因為營救了宇航員而受到英雄一般的禮遇。但魔形女與X教授爆發了激烈的沖突。X教授為了讓人類接納變種人，常常讓X戰警委曲求全，自己陷入危險境地。
而魔形女則認為X教授應該多考慮一下變種人自己的安危。野獸漢克對琴進行了體檢，發現琴的能量大幅增加了，其能量高到現有的儀器根本測不出來。
晚上，在一個湖邊，三個不明物體悄然降落。一群德巴力星人從中出現，它們殺害了附近一群正在聚餐的人們，并化裝成他們的模樣。
X戰警的營地內，眾人正在舉行篝火派對慶祝任務勝利。琴發現自己的各種興趣、沖動比以前強了不少。在喝下無數杯酒后，周圍嘈雜的人聲讓琴再次失控，她釋放出巨大的沖擊波，將周圍的樹震斷，將人擊飛，而琴自己也失去意識昏倒在地。
正在受邀參加國宴的X教授通過心靈感應察覺到了琴的異樣于是匆忙返回。
對著昏迷不醒的琴，X教授利用意識機器進入琴的思維。他發現琴的能量太過強大，以至于他在琴的腦中植入的一個“意識防火墻”瀕臨崩塌。