出征時候3500人，折了大幾百人的祖承訓自然要給大明朝廷一個說法。
他向楊紹勛告狀說是一營朝鮮軍隊投靠了日軍，反過頭來攻擊自己，才使得自己戰敗。
而對朝廷派來聯絡朝鮮的官員徐一貫說是因為看到了朝鮮將領李薲似乎與日軍有聯絡，，他怕朝軍與日軍有勾連，這才帶著大軍提前撤退。
在他撤兵后不久，日軍還追了出來，要不是自己機敏擊退了追兵，恐怕軍士就要淪喪在平壤了。
事實上事后楊紹勛詢問其麾下將士，得到了與祖承訓一樣的答復說，有穿著朝鮮軍軍服的朝鮮人在城內與他們作戰，甚至有人拿弓向他們射箭。
彼時朝鮮人并不知道祖承訓給大明了這樣的報告，朝鮮王李昖甚至再派人要求遼東將祖承訓再次派來朝鮮與日軍作戰。
這一行為在楊紹勛眼中就好似朝鮮與日軍早有聯絡，要將祖承訓及麾下所部害死一樣。
隨即他當場對著來聯絡的朝鮮官員怒斥道“自古以來，安有大國為小國勞動許多兵馬，救濟急難于數三千里之外者乎
而爾國將官，不此之思，皆落后不肯上陣，獨驅吾兵犯賊。且賊中多有善射者，說汝言語，穿爾等軍服，是何等意思”
楊紹勛的話就差明著質問朝鮮是不是與日軍勾結坑害大明士兵了。
面對楊紹勛的質問，朝鮮使者只能承認有部分朝鮮人以身事賊，成為了跟在日本人屁股后面的朝奸。
聽到楊紹勛質問的李昖非常害怕，急忙派出官員去大明解釋。遼東巡按御史李時孳zi與遼東巡撫郝杰接受了朝鮮方面的辯解，并表示這可能的祖承訓想要推卸戰敗責任而對朝鮮的污蔑，讓朝鮮方面放寬心，大明不會怪罪。
然而雖然話是這么說，也沒見大明那邊對祖承訓有什么特別多懲處，很明顯此前朝鮮使者面對楊紹勛質問抖落出來的話起了作用，讓大明對朝鮮的疑心變重了。
退一萬步講，祖承訓和麾下明軍又分不清哪邊是朝鮮官軍，哪邊是日方朝鮮仆從軍，看到穿著朝鮮軍服，說著朝鮮話的人對自己動刀子，很容易認為是友軍背盟，因而從前方撤退也沒有做錯。
這么看來，李時孳與郝杰對朝鮮官員說的話，更像是一種安撫，盡可能的拖延日軍入明的時間，等到大明騰出手來，就算朝鮮與日本方面聯手了，也能一起收拾了。
小西行長在平壤之戰之后，對明軍作出了一下的評價“熟云明軍無勇此戰勝負在天。今雖敗歸，其實甚勇難當云。”
可見在平壤之敗后，明軍的戰斗力給了小西行長很深的印象，讓他清楚的認識了對方的戰斗力。
還記得出征前秀吉對明國的評價嗎
當日秀吉有言“至于漢土，文弱成習，不能當我武必矣。”
然而事實是日軍付出了慘重的代價這才堪堪擋住明軍的攻勢，這還是明軍陷入不利的情況下，日軍依舊不能拿下明軍。
后來其不止一次的詢問朝鮮向導，日軍是否能戰勝明軍，由此可見經過平壤之役對他的打擊很大，直接把他的自信打沒了。
恰逢此時，建州女真酋長努爾哈赤派麾下馬三非前往明國朝貢。馬三非替努爾哈赤向石星稟告說努爾哈赤是忠勇好漢，麾下有旗本三四萬眾，步卒五萬余人，可以提朝廷入朝“征殺倭奴，報效朝廷。”