黃門蘇文、姚定漢置之公車令空舍，盛以小棺，將衛皇后葬在長安城南桐柏亭。
劉據的眾門客，因曾經出入宮門，所以一律處死；凡是跟隨劉據發兵謀反的，一律按謀反罪滅族；各級官吏和兵卒凡非出于本心，而被劉據挾迫的，一律放逐到敦煌郡。
因劉據逃亡在外，所以開始在長安各城門設置屯守軍隊。
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在聽說衛子夫幾天前，見過無垢，就立刻讓人抓無垢，可是冠軍公主府時候，一個人也沒有，留下一封信。
漢武帝憤怒異常，唯有壺關三老令孤茂敢上書漢武帝為劉據申冤，當看道冠軍公主玉無垢的信以后，漢武帝冷靜下知道自己錯了，而劉據知道自己難以逃脫，自縊而死；劉據有三子一女，全部因巫蠱之亂而遇害，劉據之子、史皇孫劉進有一子劉病已幸存，尚在襁褓中，后改名劉詢，為漢宣帝。
官吏和百姓以巫蠱害人罪相互告發的，經過調查發現多為有不實。
漢武帝憐惜劉據無辜遭害，便特修一座思子宮，又在湖縣建了一座歸來望思之臺，天下人聽說這件事后，都很悲傷。
巫蠱之禍，豈不哀哉！此不唯一江充之辜，亦有天時，非人力所致焉。
巫蠱之禍后漢武帝以前任命的丞相有竇嬰、許昌、田蚡、莊青翟、石慶、公孫賀、劉屈犛、田千秋幾人死的沒有幾個，太尉之位的田蚡、衛青、霍去病、霍光四人就剩下霍光。
御史大夫的莊青翟、韓安國、公孫弘、張湯、石慶、卜式、兒寬、杜周、桑弘羊也就剩下幾個。
王臧、孔臧、韓延年、李廣、李敢、韓安國、張騫、路博得、灌夫、公孫敬聲、張湯、趙禹、郭居、王恢、李息、田千秋、韓安國、鄭當時、劉受、顏異、王溫舒、尹齊、汲黯、朱買臣、江充、石慶、公孫弘、汲黯、兒寬、減宣、東方朔、主父偃、司馬遷、蘇武、周亞夫、董仲舒、司馬相如等重臣已經相繼死去，漢武帝一手建立了強大的大漢王朝也一手毀滅掉了大漢。
公孫敖因其妻涉巫蠱案受到牽連，腰斬而死，全家被滅。
漢武帝時期開始，國力強盛，大破匈奴，遠征大宛，降服西域，收復南越，吞并朝鮮，設置西域使者校尉正式將西域納入中華版圖?，一說漢宣帝設置西域都護才正式將西域納入版圖，西漢版圖東抵日本海、南吞交趾、西逾蔥嶺、北達陰山，奠定了漢地范圍；漢武帝時期，張騫出使西域，開辟了絲綢之路，第一次將天朝的目光投向了世界，漢使到達了大宛、康居、大月氏、大夏、安息、身毒（即印-度）、于闐、扜罙、犁軒等諸國，開拓了連接歐亞大陸的絲綢之路。
但是這一切因為漢武帝興盛也因為漢武帝差一點走向毀滅，兵仙之稱的韓信因為蕭何成功，也因為蕭何被殺，而大漢成敗也在漢武帝。
此時的長安，經過遠征大宛，車師（姑師）之戰，樓蘭之戰，龜茲之戰，莎車之戰，征服朝鮮，開拓閩越，開拓西南，改革幣制，獨尊儒術，創立太學，絲綢之路，巫蠱事件的漢武帝下輪臺罪己詔。
朕欲益民賦三十助邊用，是重困老弱孤獨也。而今又請遣卒田輪臺。輪臺西于車師千余里…………乃者貳師敗，軍士死略離散，悲痛常在朕心…………
當今務，在禁苛暴，止擅賦，力本農，修馬復令，以補缺，毋乏武備而已。郡國二千石各上進畜馬方略補邊狀，與計對。
漢武帝罷黜百家，表章六經，遂疇咨海內，舉其俊茂，與之立功。興太學，修郊祀，改正朔，定歷數，協音律，作詩樂，建封禪，禮百神，紹周后，號令文章，煥然可述，后嗣得遵洪業，而有三代之風。如武帝之雄才大略，但其窮兵黷武和晚年的巫蠱之禍為其留下負面的污點。
漢武驕奢，國祚幾絕，疲弊華-夏，所獲無幾；外攘夷狄，內脩法度，封禪，改正朔，易服色。
自此，漢武帝不再出兵，而第二年馬通、馬何羅等謀刺武帝，金日磾發覺并保護了漢武帝，劉弗陵的母親鉤弋夫人“因過”受到斥責，憂死于云陽宮。
一般認為是子幼母壯，為了防止鉤弋夫人重演呂后稱制的局面，漢武帝找借口處死了她。
又過了一年，漢武帝病重于彌留之
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