是的，在孫承宗和徐光啟的二選一中，朱由檢最終還是選擇了孫承宗入閣，放棄了讓徐光啟入閣的打算。
但實際上徐光啟并非是朱由檢放棄的，而是他自己主動要求放棄的。
和其他候選人恨不得如孔雀開屏般極力展現自己才能不同，徐光啟覲見朱由檢第一句話便說自己入閣不合適。
徐光啟認為，他現在正在做的是觸動士紳階級根基的事兒，如果他進入內閣的話，那就太招人耳目了，很容易令他成為眾矢之的。
他自己成為眾矢之的不要緊，只是他正在推行的大學教育改革便有半途而廢的危險，所以他寧愿自己不入閣，只安安靜靜地做個教育家，不入朝堂爭權奪利。
徐光啟韜光養晦的策略用后世話來概括便是悄悄地進村，打槍的不要。
朱由檢想了想，覺得徐光啟考慮的比自己成熟多了，自己之所以想要徐光啟入閣，無非是為改革立一塊招牌罷了。
但徐光啟一旦成為改革派的招牌，就會成為東林黨人攻擊的標靶，以徐光啟的黨爭能力，鐵定會被東林黨人擠兌得毫無招架之功。
而且現任內閣輔臣都已經投靠了朱由檢，朱由檢對內閣的掌控力度是大明立朝以來極為罕見的，基本上朱由檢想要推行什么政策，只要不太過離譜，百分百都會通過。
所以徐光啟入不入閣，并非朱由檢一開始想的那般重要，朱由檢之前猶豫不定，其實是鉆入現代思維的牛角尖了，以為徐光啟坐的位子越高，改革才越順利。
卻沒想過徐光啟的位子越高，阻力也就越大，如今徐光啟主動放棄入閣，倒是讓一直困擾朱由檢的二選一難題迎刃而解了。
孫承宗入閣，那入閣面試中表現最為出色的王在晉怎么辦？
朱由檢的算盤是孫承宗入閣后組建軍機處，孫承宗為軍機處的軍機大臣，而王在晉則遷任中央朝廷的兵部尚書之職，孫承宗主要負責軍令，王在晉負責軍政。
按照現代說法，那便是王在晉擔任國務院轄下的國防部長之職，孫承宗則擔任軍委排名第一的副主席。
……
下午，朱由檢有了決斷之后便召集內閣輔臣到文華殿議事。
一套陛見禮儀完成后，黃立極便迫不及待的問：“陛下，經過上午的入閣面試，不知道陛下圈定入閣人選了沒有？”
朱由檢點點頭道：“朕意已決，屬意孫承宗入閣擔任武英殿大學士，加太子太師；戶部尚書郭允厚兼領文淵閣大學士，加太子太傅；錢謙益入閣擔任東閣大學士，加太子太保。”