但眾神實在太寂寞了，于是，十二尊神化作人形進入凡界地，跟各族結合通婚，慢慢有了后代。尊神后代的逐漸融合，上古神脈的血緣越來越稀薄。于是便開始不再細分是何種神族，都生來直接入了神籍。
因為正統之神代代相傳，然能精于修煉的后代，少之甚少，于是上古尊神流傳下來的神力，便一代代式微，也逐漸融入凡地界。然總有淘汰未完全的敗者，時時隱沒出現，每每一出現，后神無法壓制，便是三界大亂之時。
又因十二尊神后代無需修行，一出生便有仙體神籍。于是天上的神仙便越來越多，為爭奪仙山與河域爭斗不休。后來是有紫薇，東華，太微，太一等十二帝君共平亂，重建九宸天秩序，推舉太微為天帝陛下，總領九宸天之事。
同期的十二帝君逐漸神隱消亡，獨獨留下了紫薇帝君與太微玉帝。紫薇帝君本已經不理世事，然尚無后輩出色者，逢有大難，紫薇帝君便不得不撐著一把老骨頭，重御蒼穹劍出手。紫薇帝君甚為苦惱。
我們的女主角阿薇，白薇仙子的一家子的身世說來實在是復雜，實在一言難盡。
這還得從魔尊重樓的爺爺輩說起，而魔尊重樓的爺爺輩就得從上古十二尊神的血脈傳承說起。
上古時期，三界十二尊神化為人形之后，重訂了十二神族，有善醫者稱醫族，有善桑田者稱農族，善仆算之術號稱巫族。這些神族后代生來性情溫和，幻化人形之后容貌俊美。
卻有兩族生出來的后代例外，巫族和醫族結合生出來一個后代。不是普通神族，似有返祖之象，其外貌奇丑，卻像上古十二尊神那樣法力亦無邊。最為人忌憚的是，無法自控，脾氣暴躁，為禍四方。
因此另外的十大尊神禁止巫神與醫神兩族再通婚，卻禁不住。巫神和醫神的長子燭尤，一日之內殺了數千神族，三界被魂魄所困，暗不見天日。十大眾尊神終于忍無可忍，合力眾仙把巫醫兩神族合族剿。
卻不想巫神與醫神幼子重樓尚未修成人形，因巫神與醫神又用元神護著，眾尊神用盡了千百種方法，也毀之不掉。上古十尊神最后將重樓逐出神籍，合用十元神為契，才把這個重樓徹底封印。
然而萬萬年之后，眾尊神皆消亡，重樓卻逐漸蘇醒，占方寸山為界，吸納周邊小妖鬼怪入魔族，自封為魔尊重樓。
魔尊重樓踐踏地獄，游戲人間，上南天門，挑戰紫薇帝君。
寂寞多年的紫薇帝君與之棋逢對手，引為知己。有帝君約束，魔尊重樓行事也收斂了些。
一日魔尊重樓與紫薇帝君大戰，不慎右肩為蒼穹劍所傷。蒼穹劍所傷之處，傷口不僅不能愈合，還不斷延伸擴大。路過瑤池，不慎跌入萬芳園，長英仙子并未嫌棄魔尊重樓貌丑，更未因其是魔族而疏遠，反而贈藥相救。
魔尊重樓為長英仙子美貌所傾，便隔三差五上南天門挑戰，屢屢與紫薇帝君相戰受傷，借此便去找長英仙子。
久而久之，這貌丑心善的魔尊重樓居然俘獲了長英仙子的芳心。長英仙子因此跟隨魔尊重樓離了萬芳園，去了方寸山。萬芳園從此無人看守，導致百草叢生，百花凋零。
西王母得知真相大怒，一紙上訴到天帝陛下，天帝早想討伐魔尊重樓，因眾神皆畏懼，紫薇帝君又不肯支持，又找不到合適的理由而罷休。
如今魔尊重樓掠奪天界仙子，霸占為妻，正是惹怒眾仙，因此天帝命紫薇帝君率百家仙門討伐魔尊重樓，圍剿方寸山，引發了神魔大戰。