從10月11號開始，城里突然爆發鼠疫，疫情從貧民窟迅速向港區乃至軍營蔓延。
鼠疫還沒控制住，城里緊接著又爆發了烈性天花。
在這年月，天花疫苗還屬于新鮮事物。在新大陸，只有原住民和大陸軍大批接種了天花疫苗。
事實上，就連在大陸軍內部，對疫苗的質疑聲也不在少數，認為接種天花疫苗反而會使健康的人感染病毒，還有人繪聲繪色的編造謠言，說什么天花疫苗是一個陰謀，接種后就會被洗腦，受到精神控制云云……
這些令人啼笑皆非的謬論，在軍隊里大行其道。要不是喬治·瓦薩親自當眾接種天花疫苗，為下屬做出了表率，并且要求全體官兵強制接種，這項政策根本推行不下去。
新大陸乃至整個瓦雷斯世界產能最大的天花疫苗制藥廠，隸屬于“生命基金會”，而在戰爭時期，“生命基金會”實際上是一個專門為大陸軍服務的防疫機構。
而在新阿瓦隆，即便當地駐軍和民眾樂意接種疫苗，也根本沒有足夠的疫苗可打，被困在天花肆虐的孤城中，只能絕望的等死。
新阿瓦隆爆發天花的消息傳揚出去，大陸軍首席駐軍牧師瑞貝卡·卡斯蒂斯立刻意識到這是一個好機會，親自執筆寫了一份報告，請求司令部授權生命基金會，盡快抽調一批疫苗，組織醫護隊，以“避免人道主義危機”的名義與克林頓將軍協商，允許醫護隊進城提供防疫急救。
這份報告在司令部引起了一些爭議，但是絕大多數將領支持瑞貝卡的倡議，最后由總司令的副官霍爾頓上校執筆，給亨利·克林頓將軍寫了一封公開信，并將原稿交付廣播站，對城內軍民公開宣讀。
克林頓將軍當然看得出來，這是大陸軍發動的一次心理攻勢，占據道德制高點瓦解守軍士氣，你還不能不領這個情，不然全城駐軍當場就得嘩變！
克林頓將軍無可奈何，只得硬著頭皮給瓦薩總司令回信，感謝他基于高貴的騎士精神提供的防疫援助。
第二天一早，一艘飄揚“生命基金會”紅十字旗幟的飛艇出現在新·阿瓦隆上空，與地面駐軍溝通過后，徐徐降落在城市中央臨時充當停機坪的廣場上。
瑞貝卡和康蒂穿著雪白的軍醫制服，面戴鳥嘴狀防疫面具，帶領一群同樣裝扮的牧師和德魯伊匆匆下了飛艇，各自提著一只手提箱，箱子里裝的是冰鎮的天花疫苗。
這支醫護隊在城里駐留了一個星期，直到4000支天花疫苗全部注射完畢，才登上飛艇，在克林頓將軍及其幕僚心情復雜的送別下，飛離新阿瓦隆。
回到司令部的當天下午，瑞貝卡和康蒂就拿著一封密信，呈交瓦薩將軍。
這是城里名流士紳們聯署的一封請愿書，請求總司令閣下慈悲為懷，和平解放新阿瓦隆。
士紳們在信中說，他們已經與克林頓將軍談妥條件，只要大陸軍放斐真人一條生路，允許克林頓將軍率領下屬和城里的鐵桿保王黨人乘船撤離，那么克林頓將軍也將做出承諾，撤退途中絕不會騷擾平民。
喬治·瓦薩召集將領們開會討論此事，歌羅法、維格拉夫和海倫娜都認為應該接受克林頓將軍提出的妥協方案，盡快結束圍城之戰，否則拖到斐真海軍艦隊趕來支援，事情就不好辦了。