東漢時與司徒、司空并稱三公。大司農：秦時稱治粟內史，景帝改稱太農令，漢武帝太初元年（公元前104年）更名為大司農。魏初設大農，文帝（曹丕）黃初二年（221年）改稱大司農，蜀、吳亦各有大司農。兩漢時大司農掌管租稅、錢谷、鹽鐵和國家財政收支，而到了三國時期，由于權力的分散則只能負責這些物資的保管工作了。
九卿之一。大鴻臚：秦時稱典客，漢初稱大行令，漢武帝太初元年更名為大鴻臚，掌管接待賓客之事。九卿之一。衛尉：秦時始置，漢景帝（劉啟）初更名為中大夫令，不久即恢復原名，掌管宮門警衛。九卿之一。太尉：同大司馬。
曹丕即位后任賈詡為太尉。太傅：輔弼國君之官，作為重臣參與朝政，掌管全國的軍政大權。曹叡即位后人鐘繇為太傅。
太常：秦時稱奉常，漢景帝中元六年（公元前144年）更名為太常，掌管禮樂社稷、宗廟禮儀。其屬官有太史、太祝、太宰、太藥、太醫（為百官治病）、太卜六令及博士祭酒。九卿之一。
太仆：秦和兩漢均設太仆，王莽一度更名為太御，掌管輿馬及牧畜之事。九卿之一。
太守：秦時設郡守，漢景帝更名為太守，為一郡之最高長官，除治民、進賢、決訟、檢奸外，還可以自行任免所屬掾史。
少府：秦和兩漢均設少府，王莽稱共工，與大司農一同掌管財貨。不過大司農掌管國家財貨，而少府則管供養皇帝。其屬官有掌管御用紙、墨、筆等物的守宮令、掌管刀劍弩機等物的尚方令、掌管衣物的御府令、為宮廷治病的太醫令。
九卿之一。中常侍：秦時始置，東漢時由宦官擔任，掌管文書和傳達詔令，權力極大。中書監令：曹操為魏王時，設置秘書令以處理尚書章奏。
曹丕于黃初初年改秘書令為中書令并特置中書監，使之排在中書令之前。
中領軍：曹操為丞相后置領軍，不久改為中領軍，掌管禁衛軍。中護軍：曹操為丞相后置護軍，不久改為中護軍，掌管禁衛軍，地位略低于中領軍。
長史：秦時始置，西漢時丞相下有兩長史，其職務相當于秘書長，即最高國務機關中事務主管。將軍幕府中亦有長史，為幕僚之長；可分令部隊出戰的稱為將兵長史。
東漢的太尉、司空、司徒三公府亦設長史，職任頗重。三國沿置不改。從事：刺史的佐官如別駕、治中、主簿、功曹等都稱為從事。
倉曹掾屬：主管倉谷之事的官員，正者稱掾，副者稱屬。司徒：西周始置，東漢時掌管教化，三公之一。司空：西周始置，東漢時掌管水土及營建工程，三公之一。
司隸校尉：漢武帝始置，負責督率京城徒隸，從事查捕奸邪和罪犯，簡稱司隸。
劉備在蜀稱帝時以張飛為司隸校尉。司金中郎將：曹操于建安十年（205）置，掌管冶鐵、錢幣和農具的鑄造的官員。主簿：漢始置，掌管文書簿笈，司空、丞相府及刺史的佐官中都設有主簿。
功曹：刺史的佐官，掌管考查記錄功勞。東西曹掾屬：曹操為丞相后下設東、西曹掌管人事工作，東曹主管二千石官員的任免，西曹主觀丞相府官員的任免。其負責人員正者稱掾，副者稱屬。
丞相：戰國時始置，為百官之長。東漢不設丞相，建安十三年（208）復置，曹操自任丞相。
“丞”與“承”相通，“丞相”就是承君主的旨意來處理國家事務的人。丞相理曹掾：丞相府中掌管司法的官員。光祿勛：秦時稱郎中令，漢武帝更名為光祿勛。王莽稱司中，東漢又稱光祿勛。
曹操為魏公后設郎中令，黃初元年（220年）又稱光祿勛，掌管宿衛宮殿門戶。其屬官有掌管賓贊受事的謁者、掌管御乘輿車的奉車都尉、掌管副車馬匹的附馬都尉、掌管羽林騎的騎都尉，而大夫、中郎將等官是否是光祿勛的屬官尚有爭議。