宋初便設置樞密院，作為主管全國軍政的最高機構，與中書門下對掌文、武大權，其長官稱樞密使或知樞密院事，副長官稱樞密副使或同知樞密院事等；另設主管財政的最高機構，宋前期稱“三司”，即鹽鐵、度支、戶部三部。其長官稱三司使，號稱“計相”；神宗改革官制，撤銷三司，將三司的大部分職權歸戶部和工部。南宋增設總領所，負責供應數路或一路各軍錢糧，并參預軍政。其長官稱“總領某路財賦軍馬錢糧”，簡稱總領。
所以，北宋前期，宰相主管民政，樞密使主管軍政，三司使主管財政。神宗官制改革后，宰相實際兼管財政。南宋時，宰相又兼任樞密使，兼管軍政。這樣，宰相再次握有民政、財政和軍政的大權。
此外，宋朝設有獨立的監察機構御史臺，其長官稱御史中丞，副長官稱侍御史知雜事，主管糾察百官，肅正綱紀。臺官有彈劾權，可以上疏言事，評論朝政，彈劾官員，還準許“風聞”論事。而仁宗又有專管規諫諷諭的機構是諫院，設知諫院事或左、右諫議大夫，凡朝政缺失、百官任非其人、各級官府辦事違失，都可諫正。臺、諫官都以言事彈劾為責，其職權其實并無多大差別，也導致后世臺、諫的合流。
中書本是有制定詔令之責，可宋朝另設翰林學士院作為替皇帝起草制誥、赦令、國書和宮廷內所用文書的機構，設翰林學士承旨、翰林學士、直學士院等。翰林學士與中書舍人或知制誥分掌“內制”和外制”，總稱“兩制”，翰林學士等還侍奉皇帝，充當顧問，涉及朝政了，侵占中書的權力。
宋初的最高司法機構是大理寺和刑部。太宗時加設有“審刑院”，其長官稱知審刑院事，官屬有詳議官。各地奏案先經大理寺裁決，報告審刑院復查，寫出奏稿，上呈中書。中書申奏皇帝論決，神宗改革官制，審刑院并入刑部。
還有宋朝同樣繼承了唐朝的寺監，設置有太常、宗正、衛尉、太仆、大理、鴻臚、司農、太府九寺，國子、少府、將作、司天、軍器六監。北宋前期九寺六監中，除大理寺、國子監、司天監、都水監、軍器監外，與三省六部情況相仿，名存實亡，職權被其他機構奪取。
元豐改制后，撤銷司天監，另設太史局，九寺五監始各專其職，設官職掌。到了趙昺主政，這些寺監也進一步被縮減，只保留了國子監、將作監、軍器監、都水監及宗正寺和大理寺。但他一直把持著宗正寺，而將作監和軍器監也劃歸內府管轄，成了內廷體系。
這也不是趙昺愛管事，是當初實在分不清內外，而當初的形勢也亂成了一鍋粥，混亂之下他也就怎么方便怎么來了，到如今也沒有人提出異議，似乎也成了定制一般