聽到這個介紹，卡慕相當雀躍，他計劃要找全所有的石環，還有獅身人面像、金字塔，然后找到屬于自己的位置。卡慕死后，作為父親的巴耶克能為兒子做的事，就是要找到所有的石環，來找出卡慕在繁星中的位置。
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在支線任務“狡猾的書記官”中，一位偉大的詩人、哲學家亞里斯托被關押了，她的妻子整天在家里哭哭啼啼。
他被抓捕的原因竟然是他寫出美妙的作品，卻被書記官尤多羅斯剽竊了。亞里斯托選擇與尤多羅斯對簿公堂，爭辯了好幾個月，到最后，夫人的丈夫被打、被嘲笑，又被扔進了囚籠。
而巴耶克要營救這位詩人，協助夫人和他的丈夫逃離這座城市，結束這場苦難。
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巴耶克為了刺殺圣蛇而潛入了亞歷山大港的澡堂中，情急之下動用了袖劍割斷了自己的無名指。而這也成為后來刺客斬掉無名指宣誓的由來。
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在一座豪宅中，巴耶克見到了埃及艷后克利奧帕特拉，而埃及艷后的出場詞也令人非常印象深刻：“我可以和你們中的任何一個人睡覺，但是……第二天早上他就要被處死。”
巴耶克知道了自己一直在追查的青銅面具人就是源自于上古維序者，而這些人此時支持法老托勒密。于是埃及艷后和巴耶克夫婦的目標一致，正式合作。
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在列托波利斯，這個地方遭受著圣甲蟲和沙暴的雙重壓迫。
巴耶克找到了列托波利斯的領袖塔哈卡，討論如何找出“圣甲蟲”的計劃。巴耶克幫助塔哈卡打退了沙漠暴徒，然而在慶功宴上，塔哈卡卻在酒里下藥把巴耶克迷昏，把他埋在沙漠中等死。
好在巴耶克叫來了自己的坐騎，塞努把坐騎的韁繩交到了巴耶克的手中，這才成功脫險。
原來塔哈卡就是“圣甲蟲”，他之所以在列托波利斯治理風沙并不是為了造福人民，而是在用隱形的身份尋找著這里埋藏的秘密。
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在追蹤“鬣狗”的時候，巴耶克進入胡夫金字塔，發現“鬣狗”正在這里舉行儀式，想要讓自己的女兒死而復生。在被擊敗后，“鬣狗”還蠱惑巴耶克用伊甸碎片救活卡慕，但巴耶克并沒有被蠱惑。
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而在主線任務中，關于埃及艷后、凱撒的歷史畫卷也隨著劇情的推進而一步步展開。
埃及艷后本來想和龐培聯合，當龐培的艦隊在登陸的時候卻被托勒密和上古維序者的部隊伏擊，全軍覆沒。埃及艷后克利奧帕特拉不得已決定和凱撒聯合，奪回對埃及的統治權。
在巴耶克和艾雅的努力下，克利奧帕特拉成功和凱撒聯合。在尼羅河之戰中，巴耶克和艾雅的英勇奮戰讓凱撒的軍隊取得了勝利，托勒密被鱷魚拖入了海底。