東漢時，以三公平分丞相的權力。太尉為三公之首，掌管軍政。屬官有長史、東曹、西曹、戶曹、奏曹、辭曹、法曹、尉曹、賊曹、決曹、兵曹、金曹、倉曹、主簿。
司徒
三公之一，掌管民政，與后來丞相的職權范圍相近。曹丕稱帝后，曾改魏國的相國為司徒。屬官有長史、東曹、西曹、戶曹、奏曹、辭曹、法曹、尉曹、賊曹、決曹、兵曹、金曹、倉曹、主簿。
司空
三公之一，掌管水土之事，位為三公之末，與后來工部尚書的權利相近。后世也常以“司空”為工部尚書的代名詞。屬官有長史、東曹、西曹、戶曹、奏曹、辭曹、法曹、尉曹、賊曹、決曹、兵曹、金曹、倉曹、主簿。
御史大夫
原三公之一，掌監察、執法，后改以司空為三公，御史大夫省。魏國建立時，以華歆為御史大夫，復有此官職。
大司馬
此官職為漢武帝初建，因將軍位同九卿，故設大司馬官職與三公同列，以示對武官的尊寵。東漢剛剛建立的時候，劉秀以大司馬為三公之一，后改為太尉。西漢末年別置大司馬一職，位在三公之上，魏晉時沿襲。
九卿
太常、光祿勛、衛尉、太仆、廷尉、大鴻臚、宗正、大司農、少府為九卿，位在三公之后，為中央各行政機關的總稱。三國以后，九卿職權漸輕，并逐步為六部所替代。
太常奉常
九卿之一，掌禮儀祭祀。下屬官職有太史令、博士祭酒、太祝令、太宰令、大樂令等。
光祿勛郎中令
九卿之一，宿衛侍從之官。下屬官職有五官中郎將、左中郎將、右中郎將、虎賁中郎將、羽林中郎將、奉車都尉、駙馬都尉、騎都尉、光祿大夫、太中大夫、中散大夫、諫議大夫、議郎、謁者仆射等。
衛尉
九卿之一，掌宮門禁衛。
太仆
九卿之一，掌車馬。下屬官員有考工令、車府令、未央廄令等。
廷尉大理
九卿之一，掌訴訟斷案，平決詔獄。類似于后來的刑部尚書。
大鴻臚典客
九卿之一，掌管諸侯和各少數民族事務，相當于外交官員。
宗正
九卿之一，管理皇族事務，一般由皇族中德高望重之人擔任。
大司農治粟內史
九卿之一，掌管一國之租稅錢谷鹽鐵和國家財政收支，職權與后來的戶部尚書相近，后世也以“司農”為戶部尚書的別稱。下屬官員有太倉令、平準令、導官令等。
少腐；
九卿之一，掌管宮中御用之物。下屬官員有太醫令、太官令、守宮令、侍中、中常侍宦官、黃門侍郎、小黃門宦官、尚書令、尚書仆射、尚書、御史中丞、蘭臺令史等。
執金吾中尉
位同九卿，負責宮外戒司，京師治安，防止出現水火之事。下屬官員有武庫令。
太子太傅
位同九卿，輔導太子。
大長秋
長秋宮是漢朝皇后居住之所在。所以大長秋其實是皇后所用的官屬的負責人，一般由宦官擔任。曹操的祖父曹騰即為“中常侍大長秋”。有些三國游戲將大長秋作為普通官職，是不適合的。
中常侍
高級太監，漢朝末年掀起腥風血雨的“十常侍”即此官職。
小黃門
中級太監。
中黃門
低級太監。
侍中
內朝官之一，位略低于九卿，秩“比二千石”。常由博學高德之士擔任，切問近對，是皇帝在管理國家時的顧問。在魏晉時期，為門下省的長官，為事實上的宰相。
尚書令