約翰對東線的外交政策與他的父親相似即挑起科尼亞蘇丹與控制安納托利亞內陸東北部的達尼什曼德王朝之間的矛盾。塞爾柱蘇丹sud還軍隊支援約翰進攻達尼什曼德王朝的城市stuni，但是和塞爾柱人的聯盟被證明是不可靠的，塞爾柱軍隊放棄了這次出征，趁夜拔營而去。
在黎凡特的十字軍國家普遍承認拜占庭對于安條克的主張是具有法律效果的，但實際上只有當拜占庭皇帝以武力威脅他們的時候他們才會承認。約翰二世在黎凡特的外交最高峰是1137年他接受了安條克親王埃德薩伯爵的黎波里伯爵的效忠。拜占庭帝國渴望被認為擁有全部十字軍國家的宗主權，其野心在在約翰在通告耶路撒冷王國國王福爾克他將去耶路撒冷武裝朝圣時便可見一斑。
宗教事務
持續不斷的戰爭幾乎占據了約翰二世的大部分統治時間，而且他不像他的父親一樣熱衷于參與神學研究和教義辯論，他看起來滿足于把宗教事務交給宗主教和教會階層去處理。只有當宗教直接影響到了帝國政治，例如有關教宗或希臘拉丁教會聯合的時候約翰才會參與其中。他還組織了許多希臘與拉丁教會間的神學辯論。
約翰和他的妻子共同參與了宗教與慈善事業，并以他們接手籌建的許多教會建筑而聞名，其中包括著名的君士坦丁堡潘托克拉托爾基督修道院，包括基督全能者教堂、圖書館和醫院。皇后去世后，皇帝在第一座教堂之北又修建了仁慈堂，對外開放。1136年增建圣米迦勒小堂連接兩座教堂，作為科穆寧王朝和巴列奧略王朝的皇家陵墓，約翰二世夫婦、約翰五世等多位皇帝、皇后安葬于此。這座修道院由三座教堂組成，它被形容為中期拜占庭帝國在君士坦丁堡最重要最富影響力的建筑之一。一座配有五所病房的醫院隸屬于這座修道院，并向所有社會階層的公眾開放。這座醫院里有許多不是修道士的專業平信徒醫生在這里工作。這座修道院還成為了科穆寧王朝的皇家墓地。
針對保羅派與博格米派異端追隨者激烈的迫害是阿列克修斯一世統治晚期的特色。盡管對異端分子的壓制措施仍然生效，但沒有記錄提及到約翰的統治時期有這樣的迫害行動。在君士坦丁堡召開的一次宗教會議中調查了在許多修道院中流傳的一位名叫nstntehryss的已故僧侶的作品。基于這些作品中包含了博格米派信條與儀式的元素，他們被君士坦丁堡宗主教etyes于0年5月下令焚毀。
皇室家族中的一位成員阿德里安科穆寧被他的堂兄約翰二世委以重任。阿德里安成為了一位僧侶并陪同約翰參加了1138年的戰役。當保加利亞作為一個自治教區需要一位德高望重的人作為主教時。阿德里安不久就被任命為保加利亞大主教。
軍事功績
盡管約翰二世曾獲得過許多次戰斗的勝利，但他的軍事戰略卻是依靠占領并控制各居住點的防御工事來構筑穩固的邊界防御。約翰二世統治時期大約組織了25場圍攻戰。