當日本海盜活動減少后，“倭寇”對明朝沿海的威脅也就小了，所以“倭寇”是以日本人作為戰斗力的主體，王直等武裝海商起輔助作用。
對織田信長和豐臣秀吉來說，重要的是一種獨立于天皇、公家以及“唐國”所影響的傳統文化框架之外的新文化，在本能寺之變前一年，織田信長曾經做過一次閱兵，當時他穿著一身金紗，而不是盔甲，除此之外他還穿著蜀錦的小襖，由猩猩緋的毛織物以及唐錦做成的鞋子等，這么做的目的是為了模仿“唐天子”，他想以中國皇帝的形象出現在人前，超越日本天皇，成為東亞世界的中心，仿佛是以游行的方式將安土城的構想展現在眾人的面前。他不想只做一個幕府將軍，因此在面對天皇任命時選擇了辭職。
完成了這個目標后，織田信長就要征服“唐國”，豐臣秀吉則認為“箭雨之國”要征服“長袖之國”易如反掌，從這種簡單的認識出發，產生了推翻天皇，搬到中國寧波，君臨整個東亞的想法。
豐臣秀吉就頒布了《關白殿許可狀》，允許傳教士在日本居住，其住宅、教所不用做士兵宿泊的義務，這也是本能寺之變以及豐臣秀吉在醍醐寺賞櫻都發生在寺廟里的原因，寺廟必須接待士兵留宿。
但條件是希望耶穌會提供兩艘大帆船，并協助在每艘船上安裝大炮，提供航海儀器和熟練的水手，因為他要組建一支兩千艘船的大艦隊。
這不只是會改變日本和東亞，耶穌會不敢擅自作主，以需要等教皇的指示推脫。于是在隔年豐臣秀吉頒布了《伴天連追放令》，宣布驅逐傳教士，要求傳教士們二十天內離開日本本土。
那時候的豐臣秀吉對教會和信徒還算溫和，只是對町人課重稅，并沒有禁止信教，也沒有禁止葡萄牙人通商，屬于西班牙的方濟各教會在京都和大阪傳教也采取了默許的態度。直至1596年，西班牙商船圣菲利普號從馬尼拉駛出后遇到了海難，船飄到了土佐。按照日本的法律，漂浮物到了岸上都是“拔荷”，奉行將沒收所有貨物和扣押船員，然而西班牙船長這時將一份世界地圖放在了奉行的面前，揚言西班牙將征服日本，并夸耀了西班牙的強大，還聲稱他們在日本有內應。聽到了土佐藩的報告后，豐臣秀吉大怒，下令逮捕方濟各傳教士和信徒24人，以內奸的名義處死，從此以后日本開始全面禁教。
豐臣秀吉死后他的兒子繼續完成他未完的工程，新鑄造的大佛全部用的唐銅，風格則是東大寺，不論是佛還是寺都要比東大寺大一些。然而在大佛快要完成的時候，鑄工不小心引起了火災，大佛和大殿都燒毀了，但秀賴還是不死心，用豐臣秀吉留給他的幾萬兩黃金全部投進去，鑄成了19米高的巨大佛像，后來又鑄造了巨大的鐘，不久就發生了銘文事件。
大佛后來成了寬永通寶的材料，尼克去看的時候大殿里空空如也，只有幾個僧人還在守著無信徒、無佛，只有一口大鐘的寺廟。
不論是水路、海路、還是陸路都被豐臣秀吉的人控制著，尤其是大津和琵琶湖，那里有糧食、修建大阪城的木材，可以用來修攻城的工具，也是京都的咽喉要道。除非這些人全部反悔了，改為支持德川家康，否則德川家康要獲得補給必須打下大津。
豐臣秀吉確實保證了日本前往海外貿易的利益，讓人們在他的管轄之下盡情做生意、積累財富，這也是他夢想的體制的一部分。等德川家康得到了政權，這些在豐臣秀吉時代風光無限的人們的處境又會如何呢？
大阪城之戰德川家康沒有獲得本土商人的支持，反而從英國人和荷蘭人那里購買他想要的一切，不論是糧食還是彈藥，這導致他最終對豐臣秀吉的后代趕盡殺絕。