不過諸葛瑾家族下場很慘，諸葛瑾去世之后，他的兒子諸葛恪也是當時吳國有名的天才少年，諸葛恪深得孫權喜愛和信任，在孫權臨終時成為顧命大臣，并且接替了父親諸葛瑾的職位為大將軍。
不過諸葛恪雖然少年時期天縱英才，但長大之后卻是言過其實，名聲大于能力。他接替父親諸葛瑾的大將軍之位，在孫權去世之后，諸葛恪也效仿其叔諸葛亮積極北伐魏國。
但諸葛恪的能力遠不如叔叔諸葛亮，諸葛亮北伐雖然沒有多大功績，但諸葛亮在內能平衡政治和經濟，穩定人心，而諸葛恪北伐卻是狂妄自大，被魏國打敗后，反而更加獨斷專權，因此諸葛恪引起了吳國權力階層不滿，后來吳國宗室孫峻聯合吳國皇帝孫亮將諸葛恪誅殺，并將其族滅。
因此諸葛瑾的后人大多受到諸葛恪牽連被誅殺了，諸葛瑾共有三子，長子諸葛恪，次子諸葛喬，三子諸葛謙。
諸葛恪被孫亮和孫峻誅殺，他的子孫也跟著受連累被殺；諸葛喬自幼被諸葛瑾過繼給諸葛亮為子，不過很可惜英年早逝，不過有一子諸葛攀，后來由于諸葛瑾家族被滅族，諸葛攀又重新恢復為諸葛瑾這一支血脈，后來諸葛攀之子諸葛顯在三國歸晉之后隱居河東郡（山西運城一帶）；三子諸葛謙被諸葛瑾自幼過繼給幼弟諸葛均為子，諸葛謙后來一直跟隨諸葛均居住于巴蜀，幸免于難，不過諸葛謙在三國歸晉之后，一心修道，并且為了避免政治清算，他改姓為諸，此后下落不明。
諸葛家族除了諸葛瑾和諸葛亮兩兄弟分別在吳國和蜀國封將拜相之外，在魏國他們還有一位族人身居要職，那就是魏國征東大將軍，統領青、兗、徐、揚四州，地位僅次于三公的諸葛誕。
諸葛誕也是瑯琊諸葛家族的杰出人物，他與諸葛瑾、諸葛亮兄弟是堂兄弟關系，他們的爺爺是親兄弟，血緣關系上相對遠了一些，所以諸葛玄南下投奔劉表時，同樣也是早年喪父的諸葛誕卻沒有被諸葛玄帶走，就因為兩人的叔侄關系相對遠了一些。
因此諸葛誕自幼就在北方長大，雖然自幼沒有父親孤苦無依，但諸葛誕憑借自身的努力步入曹魏政壇一路平步青云。
諸葛誕為官比較有拼搏精神，干起事來有股子拼命三郎的勁頭，所以他在官場很快就獲得魏國核心權力階層人物夏侯玄的賞識，被提拔重用。
而且說諸葛亮與司馬懿有姻親關系還就是從諸葛誕身上而來，諸葛誕在魏國身居高位之后自然會得到司馬懿的拉攏，兩人由此結成兒女親家，諸葛誕的女兒嫁給了司馬懿第五子司馬伷為妻，所以諸葛亮因為這層關系也就和司馬懿有了一點姻親關系。
諸葛誕雖然是司馬懿兒女親家，但他卻不屬于司馬氏集團的人，諸葛誕更加忠于曹魏皇室，后來司馬懿之子司馬昭取得魏國大權，已經做到了司馬昭之心路人皆知威脅到魏國皇位時，諸葛誕舉揚州之兵，以討伐司馬家族名義企圖入京誅殺司馬昭，最終被揚州被司馬昭平定，諸葛誕家族幾乎被族滅，只有兒子諸葛靚逃入吳國幸免于難。
后來司馬炎篡位立晉之后，冊封叔叔司馬伷為瑯琊王，封地正好就是諸葛家族的故鄉所在地，也算是讓嬸嬸諸葛氏回歸故鄉吧。