同年十二月，王陽明受封特進光祿大夫、柱國、新建伯，世襲，歲祿一千石，然不予鐵券，歲祿不發。
明世宗嘉靖元年正月，王陽明上疏辭讓新建伯爵，沒能得到批準；
同年二月，其父王華去世，王陽明還鄉丁憂；
同年七月，王陽明再次上疏請辭爵位，依然未予批準。
此后數年，王陽明長期棲居浙江，不問政事。
明世宗嘉靖六年，兩廣地區思恩、田州民族首領盧蘇、王受造反，王陽明得旨起復，出任都察院左都御史，總督兩廣及江西、湖廣軍務。
出征途中，王陽明提出了招撫為上策，征剿為輔助的平叛策略。
同年十二月，王陽明率軍抵達思恩，盧蘇、王受不戰而降；
嘉靖七年二月，王陽明揮師南寧，思田叛亂迅速平息；
嘉靖七年七月，八寨、斷藤峽盜亂進剿殆盡，思田靖亂全面獻捷。
王陽明的肺結核病情因戰事而進一步惡化。
他數次上疏朝廷，乞求告老還鄉養病，但始終未得批復。
平定思田叛亂后，王陽明于當年八月，不等朝廷回復便啟程返鄉。
十一月二十九，王陽明在歸鄉途中，于江西南安府大庾縣青龍鋪在船上病故，臨終前留下遺言：此心光明，亦復何言。
王陽明死后，靈柩于次年回歸紹興故里，葬于山陰洪溪。
然而，朝廷卻認為王陽明在沒有得到命令的情況下，就啟程歸鄉，屬于擅離職守，因而停止其爵位的世襲，不封謚號，禁止陽明學。
盡管如此，陽明門人仍然四處建立陽明祠，傳播陽明學。
直到隆慶元年，新即位的明穆宗朱載坖才同意，追授王陽明為新建侯，謚號文成；
次年又允許王家后人世襲新建伯爵位。萬歷十二年，王陽明從祀孔廟，為明朝有資格從祀孔廟的四人之一。
王陽明繼承儒家民本思想，提出治國理政必先親民、愛民。
主政江西廬陵期間，上任伊始便公開上疏爭辯，為民減免苛捐雜稅。
巡撫南贛戡亂時期，王陽明在籌集平叛軍餉過程中，通過向朝廷具陳上表《疏通鹽法疏》，諫言改革南贛官鹽征稅流通管理體系，繼而達成了籌響不加重稅負，辦事不驚擾民眾的良性治理；
南贛由亂到治階段，王陽明又基于民本思想，再度上表《議南贛商稅疏》，諫言將南贛地區征得鹽稅用之于民，恢復經濟建設，減輕百姓負擔，有力促進了南贛地區的社會經濟恢復性發展。</p>