原本的歷史線上很可能就是因為難民太多，以至于沖擊城市，導致了那些組織力不夠的國家政府徹底崩潰，原本沒有受災的地區，也變成了難民區，導致滾雪球一樣的災難，最終造成了比災害過程中的直接傷亡更大的多的死傷。
除了受災最為嚴重的南美和澳大利亞南部，非洲南部，印度洋北岸，亞洲東南沿海地區，也有藍諾在負責疏導當地秩序，這些地區距離南極雖然較遠，海嘯到他們這里的時候已經削弱了許多，但沿海地區還是遭到了毀滅性的破壞。
這些沿海地區本來就是人口密集區，特別是印度洋北部和東亞，東南亞地區，那里幾乎是地球上人口最稠密的地方，又不是所有國家組織力都像某個變態那樣，自然是要分配相當多的人手前往那些地區去恢復秩序。
這其中就包括了日本，這里雖然不是受災最嚴重的地區，但卻是人口最密集的地區之一，地球上人口密度最大的城市之一，就位于這個島國之上。
而在藍諾們在安置難民的同時，碇真嗣也出生了，雖然他的靈魂已經是解開了二階基因鎖的狀態，但現在他的記憶幾乎被全部抹除，只不過是一個嬰兒。
而此時的碇源堂，還是個年輕人，還沒有，整天戴著墨鏡，也不會標準的司令姿勢，看起來更是顯得有些瘦弱。
這個時候的他還和碇唯過著看起來幸福美滿的生活，相比于碇唯，碇源堂對于自己的這個孩子并沒有特別喜愛，屬于那種在生產過程中如果出了問題的話，會果斷選擇保大的類型。
不過在碇真嗣還小的時候，碇唯還沒有融入到初號機里的時候，碇源堂對待自己的孩子的態度還算不錯。
人類進化研究中心中，碇唯逗弄著碇真嗣，對身邊的碇源堂道“我們的孩子未來一定會成為一個偉大的人的。”
碇源堂聞言看著襁褓中的那個嬰兒，隨后點了點頭“應該吧”
兩人各自都有各自的秘密，只不過這個時候的碇唯，知道的，其實比碇源堂多一些。
碇唯也是能夠在輪回之中保留自己的記憶的，雖然不至于像藍諾這么變態，連世界重塑的過程都能夠清晰的看到，但關于世界輪回，關于生命果實和智慧果實，關于人類補完和第三次沖擊，第四次沖擊的事情，她都還清晰的記得，這也是她在實驗過程中會主動融入到初號機之中的重要原因之一。
碇源堂在拿到了尼布甲尼撒之匙后，也擁有了一定程度的在輪回之中保留記憶的能力，但和融合到初號機里的碇唯相比，還差了很多，至少在碇唯融入到初號機內部之前，碇源堂的記憶都沒有蘇醒，不然的話他無論如何都會阻止這個過程。
碇唯所說的碇真嗣將成為一個偉大的人，并不是一個祝愿，而是一個預言，因為碇真嗣每次都會作為人類補完的主導者，而他如果無法成為一個偉大的人，讓人類補完有一個完美的結局，那么輪回就會一直持續下去，直到他成為這樣的存在，這其中本身就有碇唯的引導。
這是一個母親，面對自己的孩子的時候，的私心，但同樣也是選擇了對人類最好的結局。
隨著第二次沖擊的爆發，世界各地都在忙于救災，相比于原本的歷史線，這一次的死亡人數少了太多太多，更是有諸多工業設施被搶救出來，重新恢復運轉，逐漸維持住了各受災地的自己自足。