講官們對于寺院的不斷擴張也是極為反感，但是東南地區佛教勢力很大，講官們建議朱載坖慎重處理。
確實，東南佛教昌盛，若是沒有一個正當理由的話，恐怕很難動這些寺院和禿驢。
朱載坖問道：“陸繹，可有什么好的理由？”
陸繹想了想說道：“殿下，何不以通倭為由？”
朱載坖明白陸繹說的意思，東南沿海倭亂興起，朝廷實行海禁，但是這些和尚僧人私創寺院，收攬民眾，在倭患嚴重時作為賊寇侵略本地的助手。這事已經是被地方州縣證實了的，倒不是錦衣衛胡亂攀咬。
朱載坖說道：“就以此為由，整頓寺院！”
朱載坖將海瑞、趙貞吉、唐順之叫來，告知自己的想法，同時希望趙貞吉以南直隸巡按的身份主持此事。
朱載坖說道：“僧侶勾結倭奴入寇，滋蔓既久，遂成大亂，若不早圖，恐生大亂也！”
對于朱載坖的看法，趙貞吉等人倒是并不反對，江南佛教興盛，確實已經到了影響大明朝廷的地步。
而且嘉靖本人對佛教就極為反感，嘉靖繼位之初，顯示出強烈地排佛意向與決心，首先就規定了寺田起科，僧道同服徭役。針對原先僧尼可以免除徭役，嘉靖作出改變，度牒僧人有田糧者編入黃冊，同里甲供應賦役。無糧者編入帶管畸零。不再享受免役特權。
同時將私度的僧人盡皆還俗，嘉靖下詔：僧徒愿自還俗者，聽其自由安便。各處寺院任其頹壞，不許修葺。民間幼童不許舍身為僧，私自披剃。凡中外一切游聚尼僧，俱勒令還俗婚配，罷毀所居浮屠庵院，違者重懲，如令詔可。
不過嘉靖的這些詔書只在京師附近有用，在南方沒什么效果，不過朱載坖這次準備在東南把嘉靖的詔令推廣下去，免得這幫和尚搞事情。
唐順之說道：“殿下，江南地區自古以來有尚鬼神崇佛的習俗。此風俗早已融入江南民眾的日常生活，在他們的觀念里根深蒂固，無法磨滅。”
朱載坖當然知道這節，如果不是這樣的話，佛教也不可能再江南發展起來。
不過唐順之的另一個觀點倒是引起了朱載坖的興趣。唐順之認為佛教在東南的冗濫，和沉重的徭役有密不可分的關系。