現在蘇松等地要求改折的呼聲極大，朱載坖也認為改折可以極大的減輕蘇松地區農民的負擔，但是對于蘇松的棉紡織業和絲織業要征收賦稅，他們在開海中獲利匪淺，自然是要向朝廷交稅的。
而且現在朝廷對于蘇松的控制已經是今非昔比了，無論是南直隸水陸兩總兵，還是蘇松錦衣千戶所，南京錦衣衛、督師南京大學士，都是朝廷對東南加強控制的措施。
朱載坖要求戶部等研究怎么征收工商稅，然后條陳上疏，由朱載坖和內閣等商議之后再施行。
除此之外，一個重要的問題就是糧食問題的解決，現在海運發達，除了湖廣等處的糧食之外，南洋的糧食也可以大量進口到大明來了，不管是緬甸還是暹羅、占城的糧食，都是非常便宜的，只要能夠將這些地方的糧食運到大明來，也可以平抑大明的糧價。
朱載坖認為，要利用海運，大量運輸暹羅、占城等地的糧食，到大明來平抑糧價，為了鼓勵商人販運暹羅等地的糧食到大明來，朱載坖在和胡宗憲、徐渭等人商量之后，下旨頒布了針對販運糧食的商賈實施稅收優待的政策，朱載坖下令：嗣后凡遇外洋貨船，來閩粵南直浙江天津等省貿易，帶米萬石以上者，著免其船貨稅銀十分之五；帶米五千石以上者，免其船稅銀十分之三，其米聽照市價公平發糶，自此，加恩之處，著為常例。
同時命令各處的海關衙門收購這些商人轉運而來的糧食，向京師、遼東等處轉運。
同時對于往來貿易的中國商人，則采取強制性的規定，要求出海華商必須運米回國。命令他們在路過暹羅、占城時，用糧食壓艙，帶運糧食。朝廷也要打造專門用于運輸糧食的大船，前往暹羅、占城等用大明的貨物換取糧食，通過海運運輸糧食到天津，轉運到京通倉和遼東等地，以供軍用。
同時就是對于鈔關的征稅，朱載坖主要是和提督鈔關衙門鄢懋卿商量，要進一步完善鈔關制度，現在鈔關關稅銀僅一百六十萬兩，不足海關關稅的一半，而實際上國內的這些富商大賈，身家百萬的比比皆是，不對他們征收重稅，實在是說不過去的。
朱載坖這次針對的主要是東南和山西的稅關，要加強征繳，重新訂立稅則，稅則分為車船料則例與貨稅則例，其船料則例由于改進了計料方法，納料較為合理。其貨稅則例，在正稅則例之外，有比例則例、規例、估價例等項則例。正稅則例中將貨物分為四大類，貨稅皆以類相從開列細則。
對于商品的流通階段，自然是通過鈔關來征稅，但是對于生產環節，一樣也要征稅，比如紡織行業要按照織機的數量加以征稅，瓷器等要按照窯口的大小和產量予以征稅，還有對于一些有軍國之用的物資，要實行禁榷制度，不準民間隨意買賣。
朱載坖在和戶部、兵部等部門商量之后，頒布了第一批禁榷的物資，包括硝石、硫磺、鉛錫、茶葉等有關軍國之用的物資，都是屬于朝廷禁榷，私人交易必須憑借茶引等憑證。
朱載坖要求戶部加強對于茶引的管理，地方州縣要詳細查明茶葉的產量和榷稅的多少，太仆寺和兵部要提前制定通過茶馬貿易交換馬匹所需要的茶葉數量，由戶部和地方州府直接向產茶戶征收本色茶稅，不足的由戶部撥銀，召商購買運輸，茶葉運輸只有官收官解和商收商解兩種模式，不允許攤派給地方百姓。
同時應俺答之請，在宣大和三邊等處增開茶市，向土默特部和西北諸部販賣茶葉，除了宣大各處的馬市之外，還增開甘肅洮岷、河州、西寧、莊浪、甘州、哈密、沙州七處茶市，除了朝廷用于交換馬匹的禁榷茶之外，商人也可以向朝廷購買茶引，販運茶葉，茶葉交換單位為蓖，每蓖重十斤。上等馬給茶十二蓖，中等馬給茶九蓖，下等馬給茶七蓖。
對于茶引，實行和鹽引一樣嚴厲的措施，私販茶葉百斤者，斬立決，偽造茶引十道以上者，斬立決，不僅對于給北方蠻夷的茶葉加以禁榷，和西洋交易的茶葉也被禁榷了，同樣要使用茶引勘合才能夠和西洋人交易，實則就是變相增加了茶稅，每一百斤加征三錢銀。
除此之外，江西的御窯廠也要為西洋生產瓷器，同時由海關衙門召商銷售給西洋人，增加朝廷的收入。
由于要對東南的這些大商人征收商稅，朱載坖擔心他們跳起來，所以準備明年再次南巡，朱載坖首先給南京內守備、司禮監秉筆劉忠下達命令，命令他修葺南京宮殿，之前朱載坖每年都下旨修葺南京的宮殿，不過這次朱載坖給劉忠的密旨中要求劉忠將南京的各處宮殿都要修葺完整，朱載坖準備奉請皇太后巡幸南京。
還有就是各地的水利設施，朱載坖給總理河漕潘季馴下旨，命令他趕赴河南，詳細巡察黃河河道，規劃河南一省的水利，不僅要保證河南不再遭受黃河水患，還要興修大量的農田水利，使得河南免于旱災的威脅。
作為中原大省，河南卻是一個多災多難的省份，水旱無時，使得本來擁有大量田地的河南貧窮不已，朱載坖希望通過水利設施的興修，使得河南百姓至少能夠免于饑饉，免于淪為流民，對于大明來說，也會安穩很多。
不過對于朱載坖準備征收商稅的事情，還沒有實行已經在朝廷傳的沸沸揚揚的，不少的蘇松籍官員上疏朱載坖，認為蘇松的賦稅本來就很重了，現在又要征收商稅，實在是難以負擔，請求朱載坖三思。
對于這些奏疏，朱載坖和內閣是一概留中不發，不予理睬，朱載坖現在已經在思考明年巡幸南京的計劃了，應該動用多少護衛官軍等。</p>