“然而如此微小的細胞中,又包含了上百億個【蛋白質】,這個【蛋白質】就是【國際蛋白質結構預測大賽】中所說的蛋白質。”安無恙說清楚了大賽中蛋白質的具體意義。
“大家可以想象得到一個蛋白質的尺度究竟有多小了嗎?”安無恙詢問。
眾人陷入沉默,或許是在心算?
一個人類大約由40萬億個細胞組成,一個細胞由上百億個蛋白質組成,那一個人類由超過四千萬億億個蛋白質組成?
‘千萬億億’?
好小眾的計數單位!
“在一個細胞里上百億個蛋白質中又包含了數十萬種不同類型的蛋白質,如果將這一個數量級再疊加上去,那是什么概念?”安無恙調侃的詢問。
“這一個【國際蛋白質結構預測大賽】就是一次拿出數種或者數十種蛋白質出來,讓參賽選手預測對應蛋白質的三維結構信息,然后根據預測的信息與實際的信息進行對比,從而評判誰更精準更快速的預測出對應的蛋白質三維結構信息。”安無恙又說明大賽的規則。
“我們剛剛說了,蛋白質相當于分子,如果從蛋白質層級再向下細化,那就能細化到氨基酸層面,目前已知的氨基酸種類大概是五百多種,但組成生命的氨基酸種類只有固定的二十種。”安無恙繼續說明。
“具體的種類我就不說了,我說了你們也不理解,雖然我自己也記不住。”安無恙嘿嘿笑著。
他只是因為家族企業耳濡目染的了解一些基礎信息而已,但深入的細節信息,他其實也沒有用心去記住更具體的東西。
“一個蛋白質可以由幾個氨基酸或者是幾十個,甚至是幾百幾千個氨基酸組成,而不同的氨基酸鏈折疊出來的蛋白質將存在不同的三維結構。”安無恙說明。
(↑蛋白質三維結構概念圖)
“不同的三維結構又決定了蛋白質的不同功能,即便是氨基酸鏈結構的微小變化,便可以讓蛋白質最終的功能有明顯的不一樣。”安無恙繼續。
“比如說大名鼎鼎的阿爾茨海默癥,便是蛋白質折疊結構出現了問題,從而導致了對應的癡呆毛病。”安無恙說了一個淺顯易懂的例子。
“關于蛋白質有一個重要的知識點,那就是相同序列的一串氨基酸鏈在相同環境中折疊出來的蛋白質總是一樣的,這又涉及到了物理學的知識,因為它們都需要達到一個相對穩定的最低能量狀態。”安無恙說明。
說到這里,安無恙又調侃的詢問,“你們這些外行人是不是已經聽不懂了?”
陳鴻志點頭,“確實有點聽不懂了!”
“沒關系,很快你們就知道我在說什么,我為什么又想要投資炭變團隊!”安無恙回應。
“【國際蛋白質結構預測大賽】就是基于這一個重要的知識點成立,畢竟在相同條件下氨基酸鏈的折疊情況都一樣,那就意味著對應的蛋白質可以被預測。”安無恙又說明。
“于是大賽的規則就是告訴參賽選手一串固定的氨基酸序列,通過已知的排列組合順序,分析預測它們折疊成蛋白質之后的三維結構信息。”安無恙介紹大賽規則。
“通過我的說明,大家理解了蛋白質的含義,以及在物理尺度上究竟有多么微小,還有數量究竟有多么夸張,現在將問題拉回到alphafold2這個人工智能系統上。”安無恙開始收束話題。