為了避免一護被自己失控的靈壓吞沒而魂飛魄散，雨龍拼命將一護過度釋放的靈力化成靈箭射向天空，使一護因此逃過一劫。事后雨龍因此體悟到，祖父真正渴望的，是滅卻師與死神的合作關系。至此才和一護化敵為友。闖入尸魂界當朽木白哉和阿散井戀次來到現世準備帶走露琪亞時，路過的雨龍奮力地保護她，但是被戀次三兩下砍成重傷。接受浦原喜助的治療后，雨龍委托浦原幫忙照顧身受重傷的一護，便先行返家休養。
由于對自己敗給死神一事感到相當不滿，加上討厭死神的緣故，為了戰勝死神，雨龍甚至還戴上滅卻師祖傳的散靈手套，獨自修行了十天，和黑崎一護等人出發去尸魂界拯救露琪亞。
在志波空鶴的幫助下，一行人成功闖入瀞靈廷。進入瀞靈廷之后，眾人以“旅禍”的身份被通緝。石田雨龍和井上織姬一起行動，途中擊敗了同樣使用飛行武器的護廷十三隊七番隊第四席一貫坂慈樓坊。為了行動方便，二人從兩位死神身上取得死霸裝作偽裝，遭到了涅繭利的人肉炸彈襲擊。
石田雨龍對涅繭利將部下作為實驗對象的行為感到不滿，讓一旁的荒卷真木造將織姬帶離現場，與涅繭利展開戰斗。涅音夢被涅繭利當作擋箭牌攻擊雨龍，石田雨龍受其影響被涅繭利的斬魄刀疋殺地藏砍中，被封鎖了行動能力。涅繭利道出了石田宗弦死亡的背后真相，激怒了石田雨龍。
雨龍使用“亂裝天傀”恢復行動，并卸下散靈手套，以滅卻師最終形態擊敗了涅繭利，但他付出的代價是失去滅卻師之力。涅繭利因為傷勢過重，將自己化成液體逃離現場，涅音夢為了感謝石田雨龍沒有殺害涅繭利，將金色疋殺地藏的解毒劑交給雨龍服下[8]。擊敗涅繭利解毒后的雨龍拖著身子朝著關押露琪亞的懺罪宮前進，在即將抵達時遇到了九番隊隊長東仙要，被后者使出斬魂刀“清蟲”的超聲波擊倒。
但東仙要不僅對雨龍手下留情，還替他申請入住四番隊救護所療傷，雨龍因此和茶渡泰虎與志波巖鷲在拘留所會合。后來因為井上織姬獲得更木劍八等人的協助，破壞了拘留所的天花板，茶渡、雨龍、巖鷲得以脫困，與一行人趕到雙殛臺，目睹了藍染惣右介等人前往虛圈的畫面。事件落幕后，雨龍給茶渡泰虎和井上織姬縫紉了新衣服，并拜托織姬將一件特別修改過的洋裝贈與露琪亞。
返回現世后，雨龍對尸魂界給一護頒發代理死神許可證的動機抱持懷疑態度。他聲明和一護見面時，兩人就已經是敵對狀態。虛圈救援被龍弦射中恢復滅卻師之力的關鍵點失去滅卻師之力的雨龍在一次回家的途中突然遭遇到大虛的攻擊。雨龍使用之前修行時儲存的“銀筒”進行攻擊，但仍舊陷入了危機。就在千鈞一發之際，雨龍的父親石田龍弦突然現身打倒了大虛
之后雨龍答應在父親提出的“與死神斷絕往來”的條件，在其特訓下恢復了滅卻師的力量。通過浦原喜助得知井上織姬被擄走后，和一護、茶渡一同闖入了虛圏。進入虛圈后，恢復滅卻師之力的雨龍輕松擊敗了艾斯林格?維納爾。進入虛夜宮后，石田雨龍與沛薛·卡迪謝一起行動，遭遇到了三位數破面緹魯蒂·桑達薇琪，在靈弓直接攻擊不奏效的情況下，配合滅卻師的另一種武器“劃破靈魂之物”成功擊倒對手。
在阿散井戀次被第八十刃薩爾阿波羅·格蘭茲逼到絕境時出手相助，并與戀次配合，成功重創了對手。隨后二人被歸刃后的薩爾阿波羅重創，危急時刻被趕到現場的涅繭利所救。目睹薩爾阿波羅敗北后，涅繭利與涅音夢為雨龍和戀次進行了治療。
被暴走的一護刺傷趕到虛夜宮第五之塔后，石田雨龍設下陷阱，用涅繭利給他的專門對付破面的地雷將牙密·里亞爾戈炸到虛夜宮底層。感知到異常的靈壓后，答應織姬的要求帶她一起到達虛夜宮的天頂上，目睹了一護被烏爾奇奧拉·西法施以致命一擊。為了保護井上織姬，石田雨龍被烏爾奇奧拉打斷了左臂。
完全虛化的一護擊倒烏爾奇奧拉后，為了阻止其繼續攻擊，被暴走的一護刺傷腹部。一護清醒后，二人接受了井上織姬的治療[68]。一護擊敗藍染后，與露琪亞、織姬、茶渡、戀次和前者會合。一個月后，跟著露琪亞、茶渡泰虎、井上織姬探視剛從昏睡狀態清醒的黑崎一護