小智游歷關都地區，遭遇了諸多挑戰，不斷收服新的寶可夢。小智遇到了包括小剛、小霞在內的許多同伴。與小霞和小剛一起的旅程中，小智仍有許多需要學習。小智完全不了解寶可夢對戰，全然通過與寶可夢們成為朋友進而捕獲寶可夢們。小智收獲的徽章中有許多是由于館主對小智的感激而贈與的。小智不斷磨礪自身作為寶可夢訓練家的戰斗技巧，并且在石英大會晉級16強。
后來小智重新鼓舞斗志，挑戰橘子聯盟，在途中遇到了小建，并最終戰勝了首席訓練家，成為了名譽訓練家。
小智其后與小剛和小霞旅行來到城都地區。在城都聯盟最終晉級八強。小智在其后同小剛，小遙和小勝一起游歷豐緣地區。并在彩幽大會晉級八強。
經歷了諸多戰斗洗禮的小智，意志越發堅定，并決定回到故鄉關都地區的對戰開拓區進行磨練。
最終成功稱霸對戰開拓區，并有資格成為開拓之腦的一員。但小智想更多地了解寶可夢和變強，所以小智決定放棄開拓之腦一職，繼續作為寶可夢訓練家踏上旅程。但是小智依舊有成為開拓之腦的特權。
小智來到神奧地區，小智與小光和小剛結伴同行。并在鈴蘭大會晉級前四強。盡管失利，小智仍是大會中讓達克多拿出第二只寶可夢的訓練家。
小智在合眾地區繼續他的修行。小智同艾莉絲和天桐一起旅行。參加了檜垣大會晉級八強。小智再度啟程前往卡洛斯地區，和希特隆、柚麗嘉和兒時的舊識莎莉娜踏上新的旅程。小智參加了密阿雷大會并獲得亞軍。
小智在阿羅拉地區體驗校園生活，與莉莉艾、卡奇、瑪奧、水蓮、馬瑪內一起學習，居住在庫庫伊博士的家中。完成了全部諸島巡禮并參加了瑪納羅大會首次獲得聯盟冠軍，亦是阿羅拉聯盟初代冠軍。后在特別表演賽上打敗了皇家巨蛋的王者皇家蒙面人-庫庫伊博士。小智作為櫻木研究所的調查研究員，看了渡和丹帝的比賽后決定參加寶可夢世界錦標賽。最終過關斬將，取得冠軍。在寶可夢！很高興與你相遇！至小智與小豪！踏上新的旅途!!