至于四川巡撫葉九思，自動亂開始就未見到他人，而當巡撫衙門被白蓮教眾猛攻之時這葉九思也未出現。城中近萬白蓮教眾洶涌而來，揮舞著武器，口中高喊著“真空家鄉，無生老母”的八字真言，悍不畏死，在王致清的指揮下付出百多人的傷亡后終于拿下了巡撫衙門。
隨后，成都各門逐一陷落，城中清軍抵抗力量越來越弱，由于自巡撫到知府，以及成都參將等各級清廷官員一直未及時出現，導致清軍無法組織起有效的反抗，至酉時，成都全部被白蓮教眾所占領，如此首府就此丟失。
成都丟失后，人們才知道四川巡撫葉九思的下落，原來當日一早葉九思就莫名其妙死在其房中，至于是怎么死的外面的傳言頗多，有的說是葉九思被人毒死的，也有的說是葉九思得了馬上風死的，但不管怎么樣，這一日蹊蹺死的在川清廷官員可不僅是葉九思一人，其究竟原因明白人自然知曉。
當日，不僅只是成都，包括金堂、彭州、簡陽、崇州、中江、樂至……等十多個州縣同時也有白蓮教眾同時起義，一時間川中白蓮教眾聚眾三十多萬，僅用三日時間就取得了以成都為中心的周邊百多里的區域地盤，起義成功后，王致清自稱彌勒在世，號三圣王，昭告天下起兵反清，以建天下樂土。
而同時，在江夏的高進部早就留一部用以迷惑清軍，而主力悄悄沿江而上，神不知鬼不覺地過宜昌，入巴東，趁清軍暫未反應過來時一舉就沖進川中，然后直接沿長江向重慶府而去。
自明末后，重慶由于多次戰亂導致人口銳減，直到康熙四年，重慶全城僅只有三千余人，作為一個府城，這點人還不如浙江的一個鎮子的人多。后來清廷采取了湖廣填四川的政策，這才使得重慶的人口逐漸增加，但至此重慶依舊未能恢復元氣，當高進部沿江而上，一口氣突然打到重慶的時候，重慶守軍根本無法抵抗，二月初二，重慶落入高進之手，這樣一來成都、重慶這川中最重要的兩座城全部被占，四川幾乎全境丟失，天下為之震動。
二月十一，王致清部同高進部在武勝匯合，兩部合二為一，此時王致清已擁兵五十萬，而高進部也擴張到了十萬人馬，合兵一處的白蓮教總兵力超過了六十萬，從兵力人數來看幾乎超過了南京的大明。
高進被王致清封為平寇王，同時下嫁其女二人，高進也不拒絕，當即同意拜王致清為主。就此兩部正式合二為一，其勢更是大振，而在江西的隆科多得知此事后驚恐萬分，連忙出兵攻擊江夏，但此時早已晚了，江夏的高進部僅留了千人虛張聲勢而已，當高進西進入巴東時，這千人已在高進的安排下早就以整化零不知所蹤，也許跟隨高進往西去了，或者返回鄱陽湖潛伏，另待機會。
二月底，消息傳到南京，正在南京準備下一步計劃的朱怡成得知此變后同樣大驚，他沒想到川中白蓮教居然會有如此動靜，而且一下子膨脹到如此程度。如今整個四川入到白蓮教手中，而且再加上高進投靠，王致清如虎添翼，以川中為基，白蓮教的觸手直接可進至鄂、豫、陜、甘四省，其發展絕對不能小視。
白蓮教如此起事使得天下局勢頓時一變，為此，朱怡成連忙招來各重臣會議，以商討對策。