經過挑選，七千軍隊中挑選出了四千五百人符合條件者，這些人全部編入戰兵營，剩下的則為輔兵，劃撥到各司從事各種生產事務。
四千五百戰兵打散之后被編為三營，分別由周遇吉、張旭，徐敷奏統率，把總、總旗等中級軍官則從王業泰家丁隊中選派人手充任。
王業泰和周遇吉徐敷奏張旭等人商議后，制定了一套訓練軍隊的辦法，分練隊列，練旗鼓，練武技，三合一循環訓練。
練隊列便是王業泰來自后世的軍訓知識，后世的人民軍隊新兵期訓練辦法。立定稍息齊步走左轉右轉這些看似沒用，但對士兵的服從性配合性極為重要，只要能經過這種嚴格的隊列訓練，便能初步具備一支強軍的素質。
然后便是練旗鼓，也就是讓士兵聽明白號令。古代的戰斗，靠的是旗幟鑼鼓進行指揮，將領的命令都是通過旗鼓這樣的方式發布，士兵們只有識得旗鼓所代表的意思，在戰場上方能做到配合嫻熟如臂指使。
最后是練習武技，一個士兵自然需要具備殺敵的本事才行。長槍兵需要熟練使用長槍，火銃火炮兵需要熟練火銃火炮的裝填發射。不管是哪個兵種，都必須經過長年累月的訓練才能具備強悍的實力。
這四千五百戰兵是專職作戰的，他們會完全脫離生產專職訓練一途，隊列旗鼓武技三種訓練以每樣訓練一個月，三個月為周期循環進行。
王業泰麾下暫設長槍兵、火銃兵、火炮兵和盾牌兵四個兵種。三個戰兵營各有火銃兵三百，長槍兵五百，盾牌兵二百，兵種設施齊全。至于火炮兵則單獨編制成營。
王業泰原本的家丁隊兩百人是火銃兵，在北京時又給北京軍械局的工匠們下單制作了五百支火銃，再加上旅順城內原有的火銃，加起來越有一千來支，能裝備一千火銃手。當然這一千火銃手除了王業泰原先的兩百火銃團家丁以外，其他八百火銃兵都是新手，需要進行長時間的訓練才行。
一千火銃兵一營三百分配給三個營，還剩下一百老兵則作為王業泰親衛。
王業泰家丁中有炮手二十余人，旅順的東江軍會使用火炮有也有二十多個，加起來有五十人。炮手少，擁有的火炮也少，除了王業泰帶來的五門虎蹲炮外，剩下的只有一門佛郎機、幾門碗口銃。王業泰仔細想過以后，撥出了三百人組建炮營，由原來的神機營把總楊小磊擔任炮營都司。
王業泰已經給新任登萊巡撫孫元化寫信，要求調撥一百門火炮來旅順，據孫元化回信他已經上奏朝廷在登州鑄炮。王業泰自己也想鑄炮，但旅順這里一窮二白，既沒有煤鐵資源，又沒有鑄炮人才，根本無法進行。
火炮短缺，長槍盾牌卻是充足，經過編制之后，三營戰兵除了盔甲不足以外，武器倒是齊全，王業泰便下令立刻進行練兵。