關于薊州鎮整訓的調整是這次會議的重中之重。
廢除衛所的種種措施，除開解放人口，給明朝的社會增加活力外，最根本的目的，還是要提高明軍的戰斗力。
張昭在西北時開始推動這件事。但彼時他遠離朝堂，初步冒頭，對朝政其實根本沒有什么話語權。對軍制的調整，只是隔靴搔癢。而此時他大權在握，自然要作出一個樣板來。
由此可見，提出一個讓朝廷同意的國家戰略來何其重要。
張昭有條不紊的道：“整訓的第一步，實兵足餉。
之前諸位吃多少空餉，我不去追查。現在都可以以裁撤掉老弱病殘的名義，在兵部的籍冊上注銷掉。但自這次整訓開始，一個空額都不允許有。
諸位的親衛都要并到編制中，由國家發放餉銀。
另外，每一個月的軍餉都要足額發放到士卒手中。誰敢克扣，別怪我軍法無情。
那么，為保證上述兩件事的執行。就有此次整訓的第二步，在每一個百戶、總旗中設立軍法官。保證軍法的執行，記錄戰場功勛、宣傳忠君愛國之思想、并教授士卒識字。職位分別與百戶、總旗相當。但不得干預軍中指揮。
這些軍法官的升遷由后軍都督府決定。這一部分的軍法官，第一批將會由新軍營和新軍營初級學堂的畢業生混合組成。第二批則在薊州鎮中產生。
因而，這就有整訓的第三步，軍官的培訓。
天子已經在詔令在京中設立大明皇家軍事學院。薊州鎮的軍官要輪流前往軍事學院中進行三到六個月的學習。學習什么？
第一，鑒于當前兵器的革新，也就是燧發槍和火炮的大規模運用，軍中的戰術要更新換代。這是每一個指揮員都需要學習的。目前的教材是新軍營的《步兵操典》。
第二，培訓大量的軍法官。確保軍隊對大明，對天子的忠誠。確保軍中晉升的公平。
以后，將門世家不再是獨有的。而是要將真正有才華的人選拔出來。
整訓的第四步，軍銜改革。
大明的軍隊體系中，其官職、稱號、品級之混亂，實在是世所罕見。搞的亂七八糟。
京營一套體系，團營一套體系，衛所一套體系，邊軍又是一套體系，禁衛一套體系，還有募兵的營哨體系。
（明軍的官職體系非常的奇葩，極其難以確認。比如團營的把總，帶兵一千，等同于千戶。而在禁衛軍中把總卻是百戶。再比如，游擊將軍有可能是都指揮，也可能是衛指揮使。）
從這次整訓起，整個薊州鎮的軍隊，全部使用統一的標準，明確軍中的上下尊卑，便于戰時指揮，核定軍餉，補充混編。
士兵標準是：輔兵、乙等兵、甲等兵。軍官的等級是：小旗、總旗、百戶（正六品）、千戶（正五品）、衛指揮（正四品）、都指揮（正三品）、總兵（正二品）、都督（正一品）。
此標準，我已經表奏朝廷，可在薊州鎮試行。等試行結束，再推行天下。”