在陳璘和申時行親自查看了之后，在報知了朱載坖之后，選定了北洋水師的平遠艦作為朱載坖的坐艦，之所以選定平遠艦，是因為平遠艦是北洋水師最新的一艘戰艦，隆慶十五年才剛剛交付北洋水師的，體型也大，達到了三千料，空間大，便于隨扈人員居住。
為了保障朱載坖，將平遠艦上的部分火炮暫時撤下，同時加以整修，錦衣親軍對于艦上的所有水手逐個進行審查，保障水手的絕對可靠。
凌云翼則是調動官軍和遼鎮鎮水師，沿路護衛，同時官軍在陸地上隨時準備接應，除此之外，凌云翼還以急遞迅速向內閣告知了此事，請求內閣在天津速調大軍和水師接應。
在一切準備就緒之后，隆慶十六年八月初三日，朱載坖和李皇后登上北洋水師平遠艦，從大連出發，回鑾京師，這次朱載坖只帶了親近臣子、內侍和少部分錦衣親軍，在北洋水師的護衛之下，前往天津。
北洋水師提督陳璘率領旗艦致遠艦在前開路，岸上的官軍隨時準備接應，而得知朱載坖走海路回天津，張居正也是有些抓狂，當即命令京營和親軍諸衛前往護駕，還有順天巡撫王錫爵，速調水師，前往接應，務必要保證朱載坖的安全。
朱載坖倒絲毫沒有緊張的意思，上船之后去視察船上的各處，慰問這些水手的，在啟航之前，這些水手們才得知平遠艦成為朱載坖的坐艦，能夠成為的皇帝的坐艦，對于這些水手們來說自然是無比榮耀的事情，對于這些水手們，朱載坖是極為和藹的，他們大部分都和太子差不多大，算起來都可以算是朱載坖的子侄輩。
朱載坖詳細詢問他們的情況，專門記下他們的名字，朱載坖在登艦之前，就已經以皇帝的名義賞賜了這些水手們，然后朱載坖親自詢問這些水手們，甚至命令孟沖將自己所攜帶的點心之類的零食遍賞士卒們，同時命令隨行的廚子就地取材，烹飪食物，朱載坖和這些士卒們一道分享。
朱載坖笑著對這些士卒們說道：“朕還是第一次坐海船，比不得諸位都是久經波濤的。”
見朱載坖如此隨和，這些士卒們也不那么拘束了，這些士卒們都是長期在海上漂泊的，對于海上的見聞還是不少的，朱載坖也就向他們了解他們眼中的各國水師，在這些士卒們眼中，朝鮮、倭國的水師不足為慮，但是西洋的船只還是確實有可取之處，他們所見到的西洋帆船，航速比大明的要快一些，吃水也深，重心更低，也就是大明的船只更加穩定，尤其是遠洋作戰的時候，這點就很重要的。
朱載坖認真聽取這些士卒們的意見，對于海上的生活，水手們普遍反映伙食太差，近海航行時還好，能夠及時得到補充，但是一旦遠洋作戰，對于水手們來說就很痛苦了，常年累月沒有淡水河新鮮蔬菜，時刻威脅著這些水手的的生命安全，對于這個問題，朱載坖也表示要考慮，最后總歸是要解決的。
朱載坖對于這些水手們的生活還是很關心，朱載坖很清楚飲食對于水手尤其遠洋水手，飲食還是很重要的，必須要予以滿足的。
朱載坖在北洋水師的護衛之下向天津進發，沿途的官軍在水陸護衛，凌云路等人更是要將朱載坖船隊每日的行進路線都要詳細奏報，同時順天巡撫王錫爵也命令天津的水師前出匯合，一道護衛朱載坖前往天津。
朱載坖經過九天的航行，終于抵達了天津，順天巡撫王錫爵等人在港口迎接，朱載坖在天津府稍事休息之后，從天津出發回到京師。
朱載坖回到京師之后，首先就是處理擠壓的政務，雖然有張居正和太子監國，但是監國并不等于的能夠處理一些軍國重務，事關國家和戰等事情這些都是要朱載坖本人親自拍板的。
朱載坖回來之后，首先就是要處理這些擠壓的政務，朱載坖先召見了閣部重臣們，了解李成梁在青海的動向，李成梁率軍已經將海虜逐出了青海，大部分的海虜西逃去投奔盤踞在西域的瓦剌部，少部分的海虜向大明投降，現在李成梁已經基本控制了青海。
現在的問題就是大明應該怎么處理青海的問題，對于大明來說，除了西寧衛之外，青海其他地方實在是難以控制，青海氣候苦寒，又是高原，對于大明來說很多官員都認為青海實際上對于大明無甚好處，但是朱載坖很清楚，青海對于大明來說是極為重要的。
首先是青海作為的大明經略西藏、西域的橋頭堡，雖然青海苦寒，青海山脈縱橫，峰巒重疊，湖泊眾多，峽谷、盆地遍布。祁連山、巴顏喀拉山、阿尼瑪卿山、唐古拉山等山脈橫亙境內。青海的位置是極為重要的，在青海的四周，東北和東部與黃土高原、秦嶺山地相過渡，北部與甘肅河西走廊相望，西北部通過阿爾金山和新疆塔里木盆地相隔，南與藏北高原相接，東南部通過山地和高原盆地與四川盆地相連。
不僅是地理位置重要，青海的草場對于大明來說確實是很重要，據李成梁的奏報，就在青海湖附近的金銀灘草原，可以牧養的戰馬可達三十萬匹，要是真有這么多的戰馬對于大明來說騎兵的戰馬就不缺乏。
除此之外，李成梁還奏報，青海所出產的青海驄，挽乘兼用，體格中等，體質結實，步伐靈活敏捷，善于翻山越嶺，是優良的乘用戰馬，善走對側步，俗稱為”走馬”。踏開疾步時，步跨大，速度快，鞍口平穩，騎乘舒適，耐粗放，耐勞苦，是官軍騎兵和輜重兵適合的戰馬。
青海出產的戰馬，體格健壯，遠勝蒙古馬，沖刺能力強，要是朝廷能夠充分利用青海的草場，大明的戰馬就不愁使用。</p>