李二考慮再三，決定任命李在古為征討龜茲的行軍大總管。
之所以選擇李在古為行軍大總管，李二主要有兩點原因考慮：
一是，考慮到李在古熟悉西邊諸國，并且多次在西邊作戰，有經驗。
二是，其他有勇有謀的將領都各自有任務，比如李勣，被安排鎮守東邊，以防止高句麗趁機出兵攻打大唐。
在任命行軍副大總管的時候，李二陷入沉思當中。
李在古見李二猶豫不決，便推薦了三個人。
這三人分別是左驍衛大將軍阿史那社爾、右驍衛大將軍契苾何力和安西都護郭孝恪。
“太傅為何推薦這三位大將為副大總管？”李二問李在古。
“回稟陛下，左驍衛大將軍、右驍衛大將軍不但軍事能力過人，而且熟悉西域，另外還有最重要的一點，這二位大將軍都是胡人，而此次用兵，需要胡人軍隊協同作戰，由這二位大將軍領兵，胡人軍隊必定聽從指揮！”李在古解釋道。
“至于安西都護，他對西域更加熟悉，與焉耆、龜茲都交過手，熟悉對方用兵之策。”
李二微笑點頭：“好，依你所奏！”
接著，李二命令兵部尚書擬旨，委任太子太傅李在古為昆丘道行軍大總管，委任左驍衛大將軍阿史那社爾、右驍衛大將軍契苾何力、安西都護郭孝恪為行軍副大總管，征發鐵勒十三州及突厥、吐蕃、吐谷渾等胡族軍隊十余萬兵馬，進攻龜茲。
所謂的十余萬兵馬，只是對外號稱，實際軍隊數量不超過五萬兵馬。
李在古本來要求朝廷出兵一萬兵馬足以取下龜茲，但李二為了萬無一失，決定增加兵馬數量。
龜茲國可不比焉耆國，龜茲國擁有兵馬五萬有余，實力不可小覷。
此次大唐出兵數萬，不單單是為了征討龜茲國，還要趁機取下焉耆國。
上一次，李在古攻破焉耆都城，撤兵之后，焉耆國被西突厥撿了個漏，趁機占領焉耆都城，立了依附西突厥的龍薛婆阿那支為焉耆王，以致焉耆國依附了西突厥，不服大唐管治。
這一次，大唐絕對不能再饒了焉耆。
李在古率領三千鐵騎離開長安，奔赴西州。
與此同時，阿史那杜爾、契苾何力等將領也從別處率軍奔赴西州。
阿史那杜爾、契苾何力還沒有到達西州，突然接到李在古的軍令，命他們不要趕去西州，率軍直接攻打西突厥的部族處月、處密二部，以便消除進軍龜茲的側后威脅。
阿史那杜爾、契苾何力聽令，隨即轉移方向，率軍直奔西突厥的處月、處密二部。
西突厥大軍知道唐軍主要是沖著龜茲而來，紛紛避讓，不想與唐軍正面沖突。
阿史那杜爾率軍攻擊處月，契苾何力率軍攻擊處密。
處月、處密軍隊只是作了輕微抵抗，便逃跑。
他們似乎知道唐軍的真實意圖，不希望因為龜茲而令自己遭受全軍覆沒。
阿史那杜爾、契苾何力不負眾望，首先擊敗處月、處密，成功消除了攻擊龜茲的側后威脅。
李在古獲知焉耆北部的處月、處密已被攻破，隨即命令郭孝恪作為先鋒率軍奔襲龜茲都城伊邏盧城。
李在古親自率軍突襲焉耆都城，以平復當年的遺憾。
焉耆國王龍薛婆阿那支得知唐軍來勢洶洶，而西突厥也無法派出援兵，嚇得棄城逃跑。
當初唐軍一兩千兵馬都攻破焉耆都城，而如今唐軍上萬兵馬突襲，且再也沒有援軍，知道必敗無疑。
他的選擇只有兩條。
一是，趕緊逃跑。