日本國自有國情體制，中華特許，由各藩按照石告分攤償還。
若各藩又不償還者，中華有權力出兵討要，出兵軍費由不償還之藩賠償。
第九款：
鑒日本國之請求，為使日本國民可用中華之物，中華天子特許日本國開放商埠關口，開展貿易，互通有無。
為方便商賈存放貨物，日本國以檢地之石高作價，租借土地于中華。允中華商人在此修筑房屋、出入不禁、售賣貨物。
租借之地，當于長崎、米子、土佐、神戶、仙臺，合計五處選定。除不得占據日本國城外，其余均可自選，以長寬十里為定，檢地石高為租金，每年支付。
租借期為二百年，期間若中華不欲繼續承租，需支付其余年份之租金；二百年期限之內，日本國不得索取歸還。
第十款：
中華商賈攜帶之貨物，需遵守中日雙方之約定，禁止違禁、禁止攜帶天主教相關書籍。
具體違禁物品，見附表一。
第十一款：
中華商賈攜帶之貨物，需以值百抽六之稅費繳納于日本國。繳納印花之后，日本國不得對此貨物征收任何形式的稅款、厘金等。沿途亦不得阻攔。
日本國可以允許貨物免稅。
第十二款：
日本國之下關海峽、紀淡海峽，中華船只皆可通行。
日本國不得設置炮臺，長府藩、小倉藩原有之炮臺，應在簽約交換當日予以拆除。
鑒于炮臺拆除之海警，若有第三方船只強闖，中國之海軍將有義務將其驅逐離開。
第十三款：
中國之艦船，不得擅自進入江戶灣。
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若擅入，日本國有權擊沉。
第十四款：
中日雙方應約束百姓漁民商賈，若在非開埠之處登陸，皆可驅離、擒獲。
若為海寇襲擾者，皆可擊沉。
中華尊重日本國之鎖國制度，任何擅自離開日本前往中國的日本國民，將予以趨離送回。
日本國應約束本國國民，勿使有海寇侵擾中華海岸之亂。
第十五款：
古云：三皇不同俗、五帝不同教。
中華尊重日本國之公武制度，不因此而干涉。
第十六款：
中華商賈，不得私自與諸藩進行貿易。
第十七款：
中華之商賈，可購買武士佩刀之身份，以便貿易中因身份而起爭執。
第十八款：
若遇風浪，中華船只可以在日本除江戶之外的港口停留避風，但不可以在五處商埠之外售賣貨物。
第十九款：
日本國為保明認真實行約內所訂各款，聽允中華軍隊暫占守長州藩之萩城。長府藩之下關當為中立區，雙發均可駐軍一千，以便換約。
又，待第一次賠款償付，中華則允諾撤出萩城。
第二十款：
本約批準互換之后，中國將釋放所有被俘的日本國俘虜——心慕中華、主動投靠的不在此列。
第二十一款：
中國將賠付因戰火波及的京都百姓房舍，每戶賠付庫銀八兩，合計庫銀八萬兩。
此款項，于換約后一月之內交付。
第二十二款：
日本國應善待百姓，應答允中華皇子于鳥取藩所答應的百姓一揆之條件；日本國應督促長州藩履行減貢三成之信約。