至此，把關條約的所有協議幾乎都達成了共識，幾天之后雙方正式簽訂了條約。
三月二十三日，李鴻章被迫在條約上簽了字。條約共十一款，附有《另約》和《議訂專條》。
主要內容為：一、中國承認朝鮮為“完全無缺之獨立自主”；二、中國割讓臺灣全島及所有附屬各島嶼、澎湖列島和遼東半島給日本；三賠償日本軍費庫平銀二萬萬兩；四、開放沙市、重慶、蘇州、杭州為通商口岸，日船可沿內河駛入上述各口搭客裝貨，日本政府得在通商口岸設立領事官；五、日本臣民可在中國通商口岸城邑任便設立工廠、輸入機器，只交所訂進口稅，日本在華制造的一切物品得免征各項雜稅，所有日貨均可設棧寄存；六、交換俘虜，中國即行釋放日本軍事間諜或被嫌逮之日本臣民。四月初八日，清政府批準了這一喪權辱國的條約。四月十四日，中日雙方在煙臺互換批準書，《馬關條約》開始生效。
而這個時候一直在南京蟄伏的劉海在得到大清國政府同日本簽訂馬關條約的消息之后，立刻大喜過望，對著左右的幕僚說道：“此天賜良機，正是我南洋飛龍在天之時。”
當天晚上劉海就寫了一封奏折，命人送到了京師。
在這封奏折之中，劉海痛斥了朝廷上的賣國賊李鴻章等人，然后用假模假樣的說道，臺灣乃是祖宗百戰所得，不可輕棄。接下來又訴說臺灣在大清海疆的戰略重要位置，同時說明臺灣是南洋水師基地所在，憤慨的請求朝廷廢約再戰。
劉海的奏折再送到朝廷之后，立刻就引起了一片的喧嘩。
慈禧等投降派自然是不愿意，本來已經得到和平的機會，怎么能就這么再次開戰？
而像光緒皇帝等主戰派，對于這一次的馬關條約苛刻的條件，是已經憤慨到了極點？
要知道大清國和列強打交道這么多年以來，從來就沒有做出過這樣大的讓步。
就連世界第一強國英國也沒有辦法逼迫大清國簽訂這樣的條約，現在竟然被一個小小的日本所達成了。
因為在朝廷上對于日本小視的習慣，由來已久，這些官老爺們能夠接受大清國被洋人打敗的事實，卻無法接受大清國被日本人擊敗的現狀。因此不滿馬關條約的人大有人在。
而劉海的這個奏折，自然引起了滿朝上下文武大臣的共鳴。
就連光緒皇帝再接到劉海的奏折之后，也是興奮異常連續，召集大門武大臣商量了幾天，準備不承認馬關條約，繼續命南洋水師全軍出動，與日本海軍決戰。
但是劉海的奏折，卻遭到了慈禧太后強力的壓制，甚至有一次在光緒皇帝召開大朝的時候，慈禧太后竟然破例地從頤和園出來來到了乾清門。
慈禧太后對著滿朝文武咆哮著，痛斥劉海不知高低，只之一時的血勇，卻不把國家大義放在心上。
同時話中明里暗里說劉海在北洋同日本人大戰的時候，坐山觀虎斗，坐看北洋水師全軍覆沒。