再后來，曹操當上丞相后，又讓人來請司馬懿，由于主人的身份變了，來人的態度很傲慢，當司馬懿想再次拒絕時，便冷冷地說道：“丞相有一句話‘寧可我負天下人，不可讓天下人負我’，如果你是聰明人，應該懂得其中的意思，如果不懂，那是丞相看錯了人，就此告別！”
聽了曹操的這句話，想起來人的態度，司馬懿出了一身冷汗，只得聽從征召，做了文學掾。
既來之，則安之，司馬懿勤于職守，用心為曹操做事。
很多人對曹操的篡漢之心，耿耿于懷，而見微知著的司馬懿，知道漢朝的權力，業已掌握在曹操手中，漢室不過是擺設而已，便多次在私下里，力勸曹操稱帝。
這樣做，其實是因曹操多疑，即便不稱帝，司馬懿也向這個掌握天下大權的丞相，表明了自己的忠心。
見司馬懿識大體，在大是大非的問題上，始終是忠于自己，曹操開始放心了，讓司馬懿教授世子曹丕。
俗話說虎父無犬子，曹操最為賞識的兒子，當然是那個想出辦法稱象的曹沖，可惜天妒其才，曹沖十三歲便夭折了。
這樣一來，在曹操的其他幾個兒子中，曹丕和曹植無疑最出類拔萃的，曹植在文學方面的素養，不僅超過世子曹丕，也勝出父親一籌，從而深得曹操喜歡，更得到了一些文人的支持，其中最有名的便是楊修。
才思敏捷，文采風流的曹植，身上卻有很多文人特有的毛病，就是恃才任性，加上沒有心機，經常喝酒誤事，才使曹操慢慢疏遠了他。
而曹丕呢，文學方面也有相當的素養，只是被弟弟曹植掩翳了光華而已，但他文武兼修，為人沉穩厚重，低調內斂，這樣的人才可堪大任，后來順理成章當上了世子。
其實，在曹丕當上世子前，曹植因才氣逼人，一度被大家看作是最可能的接班人，連曹操本人，因喜歡文學，從而愛屋及烏，早期也看好曹植。
當司馬防與八個兒子探討這個問題時，七個兒子都像普通人一樣，看好當時風頭正勁的曹植，司馬懿則完全相反，且語出驚人：“曹植飲酒不節，意氣用事，如果讓他當接班人，隨時都可能將父親的功業傾覆，丞相英雄一世，閱人既多，辛辛苦苦打拼而來的事業，怎么可能交給一個書生意氣的兒子！”
他的七個兄弟，都堅持已見，連父親也懷疑司馬懿的看法。
到后來，曹植屢次因酒誤事，曹操只得確定曹丕為世子，司馬防不得不佩服二兒子的眼光毒辣。
當然，司馬懿作為老師，在支持曹丕當世子的過程中，也作了不少努力。但他很清楚，這是別人的家事，何況曹操多疑，稍有不慎便會招來殺身之禍，因而一直做得很隱晦。
而這個時候，曹植陣營中的聰明人楊修，為人鋒芒畢露，并大張旗鼓地支持曹植。當曹丕成為世子后，曹操對自以為是，又干涉自己家事，一直為曹植出謀劃策的楊修深惡痛絕，后來終于找到一個機會，便以“雞肋言論”擾亂軍心為借口，將其殺了。
由此看來，司馬懿是有先見之明的。
曹丕如愿當上世子，機心很重的司馬懿，行事更加小心謀慎，最后還是被曹操這只老狐貍看出來了。
在曹操看來，司馬懿滿腹韜略，卻忍辱負重，深韜養晦，于是擔心后人不是對手，控制不了這個陰有二心的奸滑之徒。
可是，司馬懿是世子曹丕的心腹之臣，又沒有把柄，曹操即便有想法，也只好暫且忍了。