其實劉瑾也不是說非殺不可，只是劉瑾擋秦睿的路了，擋著秦睿給人民力量小組進入朝局的路。秦睿之所以留下劉瑾，也是為了讓他把一些人給嚯嚯一下，然后再拉攏一批人，這樣就可以清理出很多職位來。
秦睿在正德皇帝殺完劉瑾之后，約皇帝吃了一頓飯，只有兩個人的飯，兩個人聊了什么旁人無從得知，只是自這天之后，朱厚照開始對大刀闊斧的調整起朝廷組織架構來。
成立國務行政院，任命謝遷為總理大臣，原有內閣大臣作為總理輔臣，總理國家事務，直接對正德皇帝負責。
原來的戶部拆分成財政、稅務、民政三部，工部分為重工業、輕工業、建設、電力、水利、商業、礦產七部，刑部改為公*安部，新增加了發展規劃部。原來的十部改為十九部，直接對國務行政院負責。
錦衣衛改為廉政監察署，受正德皇帝直接領導，秦氏集團原來的監察室人員，全部轉入廉政監察署。
都察院改為檢**院，御史不得風聞奏事，以公*部和廉政監察署的調查為準，進行公*訴。大理寺改為最*法*院，與公*部組成大明的司**系統，直接向正德皇帝匯報。
三品以上官員，由國務行政院提名，正德皇帝批準后才能任職。
一系列的部門改革，五道口經濟學院、上海大學、天津科技學院的一些畢業生以傳奉官的身份進入這些部門，也有大量人民力量小組的人走上了主要的領導崗位。
長公主朱秀榮以代理部長的身份，統領發展規劃部。
大明官場開啟了短暫的混亂局面，走科舉之途上來的一群人心有不甘，自己寒窗苦讀數十載，才一舉高中穿上官衣；憑什么經濟學院、上海大學、天津科技學院的人，可以不經科考就能做官？
從中央到地方，無數的官員開始上書，請求正德皇帝循祖宗成法，尊圣人之道，甚至有儒生抬著孔圣人像游行，但此時秦睿辛苦數十年的教育布局顯示出了強大的威力。
因為希望工程的收益人群有幾百萬，比儒生多了去了，大明如果不采取科舉取士，他們絕對是受益最大的一群人。加上五道口經濟學院這么多年，培訓出來的中低級官吏，也為支這一政策搖旗吶喊，畢竟在五道口經濟學院學習的東西，遠比讀孔孟之道學到的知識多得多，還更加務實不務虛。
儒生和士紳們也發現老百姓忽然不好管理，不再是他們說什么就是什么了，投獻土地的人越來越少，一切都在悄然間轉變，看上去沒什么改變，但等轉過頭來看時，已經物是人非了，他們不明白到底發生了什么改變。
對于公主朱秀榮出任發展規劃部的代理部長一事，儒生和文官集團也發表了自己的意見，拿武則天、呂后的例子來說事，認為這是牝雞司晨，非國家之福，公主干政應該自我了斷，以謝天下。